9 results
Search Results
Now showing 1 - 9 of 9
Master Thesis 2,3-di(2-piridil)-kuinoksalin Ligantı İçeren Platin(ıı) Komplekslerinin Sentezi, Karakterizasyonu, Elektronik Yapıları ve Dna'ya Bağlanma Kabiliyetleri(2018) Hesıen, Rehab A.yaakub; Özalp Yaman, Şeniz; Özalp Yaman, Şeniz; Yaman, Şeniz Özalp; Chemical Engineering; Chemical EngineeringDüşük toksik etkiye sahip ve kanser hücrelerinin direncini yenebilecek antikanser etkisi gösteren metal kompleksleri hala ilgi çeken ve üzerinde çalışmalar devam eden bir alandır. Birbirine eşit ya da yüksek antitümör aktivite gösteren birçok metal kompleksi sentezlenmiştir. Bu çalışmada, cis, asimetrik ve bis geometrisine sahip ve 2,3-di(2-piridil)-kuinoksalin içeren yeni platin kompleksleri sentezlenmiş ve yapıları spektroskopik teknikler kullanarak çözümlenmiştir. Komplekslerin DNA'ya bağlanma kabiliyetleri UV-titrasyon, termal bozunma, vizkometrik ve florometrik ölçümlerle belirlenmiştir. UV-titrasyon yöntemi ile elde edilen termodinamik parametreler komplekslerle protein arasında istemsiz bir etkileşim olduğunu göstermiştir. Komplekslerin sitetoksisite deneyleri MDA231- meme tümörü üzerinde çalışılmış ve IC50 değerleri hesaplanmıştır. Komplekslerin etkileşim türünün DNA boşluklarına tutunma veya elektrostatik etkileşim olabileceği belirlenmiştir. Öte yandan, sentezlenen komplekslerin meme tümörüne karşı nötr ortamda önemli bir sitoksisiteye sahip olmadığı gözlenmiştir DNA bağlanma çalışmaları tüm komplekslerin DNA'nın boşluklarına tutunduğunu ya da elektrostatik bir etkileşim yaptığını göstermiştir. MDA231 hücre hatlarında yapılan sitotoksisite deneylerinden oldukça umut verici sonuçlar elde edilmiştir. Tüm kompleksler içinde cis-geometrisinde bulunan komplesksin meme kanserine karşı en etkin ajan olduğu gözlenmiştir. UV titration, thermal decomposition, viscometric and fluorometric measurements were used to determine the binding ability of the complexes to CT-DNA. Thermodynamic parameters which were from the UV titrations indicated a spontaneous interaction between the complexes and the protein. Cytotoxicity tests of the complexes were performed on breast cancer MDA231 cell lines at neutral medium and IC50 values were calculated for each complex.Master Thesis Oxime Ligand'ı Bazı Bazı Palladyum(ıı) Komplekslerinin Sentez, Elektrokimyasal ve Spektroskopik Davranışları(2018) Elkhajkhaj, Maraı; Yaman, Şeniz ÖzalpBu çalışmada, [Pd(L)Cl2] (L= piridin oksim, piroloksimvetiyofenoksim) kompleksleri hazırlanarak elektrokimyasal davranımları dönüşümlü voltametre yöntemi ile DMF-(n-C4H9)4NBF4 çözücü-elektrolit çifti içinde, oda sıcaklığında Ag/AgCl referans elektroduna karşı çalışılmıştır. Palladyum komplekslerinin sabit potansiyel elektrolizleri ilk yükseltgenme tepe gerilimlerinde yapılmış ve UV-Visspektrofotometre ile izlenmiştir. Komplekslerinin elektrokimyasal yükseltgenme mekanizmalarını çıkartabilmek ve yükseltgenme ürünlerini tanımlayabilmek amacıyla spektroelektrokimyasal çalışmalar soğuk ortamda tekrarlanmış sonuçlar kütle spekturumu, FTIR analizleri ve krono-kulometrik ölçümlerle birleştirilerek değerlendirilmiştir. Pd(II)-oksimkomplekslerinin elektrokimyasal yükseltgenmesi sırasında elektronun ligand bazlı bir orbitalden alınarak oksim ligandının dimer oluşturduğu ve yükseltgenme sırasında ayrılan ligand yerine çözücü moleküllerinin koordine olduğu saptanmıştır.Master Thesis Nitro İmidazol İçeren Enerjik Koordinasyon Bileşiklerinin Sentezi, Karakterizasyonu ve Termal Özelliklerinin İncelenmesi(2022) Yaman, Vahide Selen; Yaman, Şeniz Özalp; Machın, Nesrin EkinciÇeşitli yapılarda üretilen enerjik malzemeler, hem patlayıcı olarak askeri alanda hem de itici güç ve piroteknik olarak sivil alanda farklı uygulamalara sahiptir. Ancak bu malzemelerin çevre ve sağlık üzerindeki olumsuz etkileri; ışık ve sürtünmeye karşı yüksek hassasiyetleri nedeniyle çevre dostu, toksik metal içermeyen ve taşınabilir alternatifleri ile değiştirilmesi önem arz etmektedir. Bu çalışmanın temel amacı, daha önce hiç sentezlenmemiş organik ve organometalik enerjik malzemelerin sentezi ve patlayıcı olarak özelliklerinin incelenmesidir. Bu kapsamda, 5-(kloro(nitro)metil)-4-nitro-1H-imizadol ile sodyum ve amonyum tuzları tasarlanmış ve ilk defa sentezlenmiştir. Daha sonra 5-(kloro(nitro)metil)-4-nitro-1H-imizadol içeren toplam 34 adet kobalt(II/III), bakır(II), demir(II/III) ve çinko(II) kompleksi farklı şekillerde tasarlanmıştır. Ancak bu komplekslerden 26 tanesi başarılı bir şekilde sentezlenebilmiş ve çeşitli spektroskopik tekniklerle (HRMS, NMR, FTIR) karakterize edilmiştir. TÜBİTAK Projesi 117Z391 kapsamında gerçekleştirilen geometri optimizasyonu hesaplarından da anlaşılacağı üzere özellikle 6 adet L- içeren kobalt(II)/III) ve demir(II)/III) komplekslerinin sterik etki nedeniyle kararsız olduğu tespit edilmiştir [1].Ayrıca elde edilen malzemelerin termo-gravimetrik ve diferansiyel termal analizleri (TGA-DSC) gerçekleştirilmiş; enerjik bir malzeme olarak kullanılma potansiyellerini keşfetmek amacıyla termal kararlılığı, termal bozunma karakteristiği ve kinetik parametreleri incelenmiştir. Eşzamanlı TGA-DSC eğrilerinden incelenen tüm komplekslerin 25-1200 oC sıcaklık aralığında yüksek bir kararlılığa ve benzer bozunma özelliklerine sahip olduğu gözlenmiştir. Bu bileşikler arasında, HL, NaL, NH4L ve beş adet koordinasyon bileşiği, yüksek sıcaklıklarda yüksek enerji açığa çıkararak ekzotermik davranış göstermektedir. HL ve tuzlarına ait ekzotermik bozunma sıcaklığının, metal iyonlarıyla koordine olduğunda 800 oC'den 1100 oC'ye taşındığı gözlenmiştir. Şaşırtıcı bir şekilde, bir veya iki L- içeren yalnızca Co(II), Fe(II) ve Cu(II) kompleksleri ekzotermik bir karakter göstermektedir. Ek olarak, bu potansiyel enerjik bileşiklerden ikisi, [Co(NH3)4(L)2] ve [Fe(NH3)4(L)2], için darbe ve sürtünme duyarlılık testleri yapılmıştır. Bu bileşikler darbeye karşı çok dayanıklı ve sürtünmeye karşı duyarsız olarak tanımlanmıştır. Elde edilen sonuçlar bileşiklerin roket sistemlerinde itici güç (propellant) olarak ve iticilere ait balistik özellikleri değiştirmek için küçük miktarlarda katkı maddesi olarak uygulanabileceğini göstermektedir.Master Thesis 2-aminotiyofenol İçeren Platin Mavisi Kompleksinin Dna Etkileşimi ve Sitotoksisitesi(2017) Salem, Safıa; Yaman, Şeniz ÖzalpCis platinin keşfinden bu yana, metal içeren ajanlar potansiyel birer antikanser ilacı olarak araştırmacıların ilgisini çekmektedir. Bu güne kadar cis platinin toksik etkilerini ve cis platin direncini azaltmak için birçok ilaç sentezlenmiştir. Bu bileşiklerden bir tanesi de 'platin mavisi' olarak bilinen, toksisitesi cis platine göre daha düşük ve antikanser özelliği yüksek olan farklı bir platin kompleksi sınıfıdır. Bu çalışmada, [Pt4(2-atp)8(H2O)(OH)] (2-atp: 2- aminotiyofenol) formülüyle gösterilen yeni platin mavisi kompleksinin DNA'ya bağlanma kabiliyeti araştırılmıştır. Pt mavisi ve DNA arasındaki etkileşim türünün belirlenebilmesi için spektroskopik ölçümler yapılmış, platin kompleksinin varlığında DNA çözeltisinin UV-titrasyon, termal bozunma, viskozite değişim ve florometrik titrasyon deneyleri tamamlanmıştır. Sonuçlar platin mavisi bileşiğinin DNA'ya kısmen interkaltif olarak bağlandığını ve antikanser özelliği gösterdiğini kanıtlamıştır.Doctoral Thesis Kinoksalin Ligantları İçeren Yeni Antıtumor Aktif Bakır ve Platin Temelli Komplekslerin Tasarımı, Sentezi ve Biyolojik Aktiviteleri(2022) Elbeshtı, Hager Sader; Yaman, Şeniz ÖzalpBugün dünya genelinde kanser en önde gelen ölüm sebebidir. Bu nedenle biyotıp ve sağlık bilimlerinde daha iyi ve güncel antineoplastik ajanlar geliştirilmesi büyük bir önem taşımaktadır. Metal temelli ilaçların kanserle savaşmak için yüksek bir potansiyele sahip olduğu bilinmektedir. Elde edilen verilerin ışığında yapılan bu araştırma ön ilaç adayı olarak (2,3-di-piridin-2-il-kinoksalin) (dpq), (2,3-di-tiyenyl-2-il-kinoksalin) (dtq), (2,3,2',3'-tetra-piridin-2-il-[6,6']bikinoksalin) (tpbq) ve (2,3,2',3'-tetra-tiyenyl-2-il-[6,6']bikinoksalin) içeren bakır(II)/platin(II) bileşiklerinin sentezi ve antikanser aktivitelerini hedeflemektedir. Sentezlenen bileşiklerin buzağı timus DNA'sı (CT-DNA) ve insan serum albümini (HSA) ile bağlanma etkileşimleri UV titrasyonu, termal bozunma, viskometrik ve florometrik ölçümlerle değerlendirilmiştir. Yapılan çalışmalar sonucunda Pt(tpbq)Cl2, Pt(ttbq)Cl2 ve Cu(tpbq)Cl2 dışında sentezlenen tüm komplekslerin CT-DNA'ya elektrostatik etkileşim ile bağlandığı, bu etkileşimin komplekslerde yer alan oynak klor iyonlarının yapıdan uzaklaşması ile oluşan kompleks katyon ile CT-DNA'nın negatif fosfat grupları arasındaki elektrostatik çekimden kaynaklanabileceği öngörülmüştür. Pt(tpbq)Cl2, Pt(ttbq)Cl, ve Cu(tpbq)Cl2 komplekslerinin ise CT-DNA ile van der Waals ve hydrogen bağı oluşturduğu sonucuna varılmıştır. Ayrıca, komplekslerin HSA'nın higroskopik bölgesine tutunduğu gözlenmiştir. Komplekslerin antitümör aktiviteleri, insan glioblastoma A172, LN229 ve U87 hücre hatları, insan akciğer A549, insan meme MDA-231, insan serviks HeLa ve insan prostat PC-3 hücre hatlarında çalışılmıştır. Hücre canlılığı (MTT), oksidatif stres, apoptoz –TUNAL, in vitro-hücre göç ve istila, in vitro-Komet DNA hasar ve plazmit DNA etkileşim testleri gerçekleştirilmiştir. Sürdürülen çalışmalar sonucunda U87 ve HeLa hücreleri, komplekslerimize en duyarlı kanser hücreleri olarak belirlenmiştir. Komplekslerin sitotoksik etkilerinin bu hücre hatlarında meydana getirdikleri reaktif oksijen türlerinin oluşumudan kaynaklandığı ve Cu(dtq)2Cl2, Cu(ttbq)Cl2, Pt(ttbq)Cl2 ve Pt(tpbq)Cl2'nin test edilen kompleksler arasında apoptoz yoluyla en yüksek DNA degradasyonu potansiyeline ve antikanser etkisine sahip olduğu gösterilmiştir. Yara iyileşmesi ve istila analizi sonuçları da bu kompleklserin yüksek antikanser aktivitesini destekler niteliktedir.Master Thesis N-(piridin-2-il) metilen benznamine içeren platin(II) kompleksinin sentezi, karakterizasyonu ve spektroskopik yöntemlerle DNA, HSA ve BSA'ya bağlanma davranımları(2017) Abdalla, Rema A İbrahim; Yaman, Şeniz Özalp; Özkan, Filiz KorkmazCisplatinin (Pt(NH3)2Cl2) yapısal analogları DNA ile benzer şekilde etkileştiği için, yeni platin temelli antitümör ilaçlarının, cisplatinden daha aktif olması ve çeşitli nedenlerle oluşabilecek ilaç direncini yenebilmesi beklenilmektedir. Bu amaçla, N-(piridin-2-il)metilen benzamin (L) ligandı içeren PtCl2 kompleksi sentezlenmiş ve karakterizasyonu tamamlanmıştır. Pt(L)Cl2 bileşiğinin buzağı DNA'sı ve serum albumin (BSA ve HSA) ile etkileşimleri test edilmiştir. Pt(L)Cl2 kompleksinin DNA'ya bağlanma mekanizmasını belirleyebilmek için çeşitli spektroskopik yöntemler kullanılmıştır. Platin kompleksi varlığında DNA çözeltisi ile gerçekleştirilen elektronik soğurma spektrumu, termal davranım, viskosite ölçümleri ve florometrik titrasyon deneyleri Pt(L)Cl2'nin DNA ile elektrostatik etkileşim yaptığını kanıtlamıştır. Aynı şekilde, spektroskopik ve viskometrik bulgular Pt(L)Cl2'nin serum proteinleri ile elektrostatik olarak etkileştiğini göstermiştir. Etkileşimin her iki protein için de hidrofobik bölgede olduğu, triptofan etrafında hidrofilite artışı ve alfa heliksler etrafında hidrofilite artışı ile ortaya konulmuştur. Öte yandan sürdürülen detaylı FTIR ölçümlerinden Pt(L)Cl2'nin BSA ya da HSA ile etkileşim noktası husunda net bir bilgi edinilememiştir.Master Thesis 2,3-di(2-tiyenil)-kuinoksalin Ligantı İçeren Platin(ıı) Komplekslerininsentezi, Karakterizasyonu, Elektronik Yapıları ve Dna'ya Bağlanma Kabiliyetleri(2018) Fadel, Wadad S. S.; Yaman, Şeniz ÖzalpSon dönemlerde, birçok geçiş metal kompleksi nükleik asit yapılarında değişiklik meydana getirerek, DNA sarmal yapısını kırmak için kullanılmaktadır. Bu komplekslerden platin(II) iyonu içeren yapılar en çok bilinen bileşiklerdir. Bu çalışmada, cis, bis ve asimetrik geometrilerde 2,3-di(2-tiyenil)-kuinoksalin içeren platin kompleksleri sentezlenmiştir. Hazırlanan komplekslerin kimyasal yapıları elemental analiz ve çeşitli spektroskopik teknikler kullanarak çözümlenmiştir. Komplekslerin DNA'ya bağlanma modları ve bağlanma dereceleri UV-titrasyon, termal bozunma, vizkometrik ve florometrik ölçümlerle belirlenmiştir. Termodinamik parametreler de yine UV-titrasyon metodunun farklı sıcaklıklardaki tekrarıyla hesaplanmıştır. Komplekslerin sitetoksisite deneyleri yapılmış ve IC50 değerleri her bir kompleks için hesaplanmıştır. DNA bağlanma çalışmaları tüm komplekslerin DNA'nın boşluklarına tutunduğunu ya da elektrostatik bir etkileşim yaptığını göstermiştir. MDA231 hücre hatlarında yapılan sitotoksisite deneylerinden oldukça umut verici sonuçlar elde edilmiştir. Tüm kompleksler içinde cis-geometrisinde bulunan kompleksin meme kanserine karşı en etkin ajan olduğu gözlenmiştir.Master Thesis 5,6-di(pyridin-2-yl)-2,3-dihydropyrazine Ligand İçeren Yeni Platin(ıı) Kompleksinin Dna ve Bsa'ya Bağlanma Bağlanma Kabiliyetinin Spektroskopik Olarak İncelenmesi(2017) Salem, Asma Mabrouk Mohamed; Yaman, Şeniz Özalp; Özkan, Filiz KorkmazCisplatin kemoterapi tedavisinin yan etkilerinin azaltılması için daha etkin ve daha düşük toksisite değerlerine sahip yeni platin kompleksleri tasarlayarak sentezlerini gerçekleştirmek bu alanda çalışan araştırmacıların ana amacıdır. Bu gaye ile, çalışmamızda cisplatinin yapısal bir benzeri olarak 2,3-bis(2-pyridil)-5,6-dihidropyrazin içeren yeni bir platin kompleksi (PtLCl2) modellenmiş, sentezlenmiş ve yapısal analizleri çeşitli spektroskopik yöntemler kullanılarak tamamlanmıştır. Kompleksin DNA'ya bağlanma tipini belirleyebilmek için UV tirasyon, florometrik titrasyon, termal bozunma ve vizikometri deneyleri fizyolojik artamda yaılmıştır. Termodinamik parametreler yine UV titrasyon deneylerinin farklı sıcaklıklarda yinelenmesi ile elde edilmiştir. Deneyler sonucunda, PtLCl2'nin DNA'nın boşluklarına tutunduğuya da elektrostatik bir etkileşim yaptığı bulunmuştur. PtLCl2'nin BSA ile etkileşimi DNA bağlanma deneylerinde kullanılan yöntemlerle benzer teknikler kullanılarak belirlenmiştir. Sonuçlar kompleksin BSA'ya proteinin hidrofobik bölgesinden bağlanarak hidrofilitesini artırdığını açıkça göstermiştir. Ptotein- kompleks etkileşim alanının belirlenmesi için yapılan ayrıntılı FTIR spektroskopisi analizleri de PtLCl2'nin etkisiyle proteinin hidrofilitesini arttığını doğrular sonuçlar vermiştir.Master Thesis Azot ve Kükürt Verici Atomlu Ligand İçeren Yeni Platin(ıı) Komplekslerinin Tasarımı, Sentezi ve Dna'ya Bağlanma Kabiliyetleri(2017) Abdusalam, Mohamed Musbah; Yaman, Şeniz ÖzalpCis platine nazaran daha etkin ve daha düşük doku direncine sahip DNA-hedefli potansiyel yeni antitümör ilaçlarının sentezi biyoinorganik kimyanın en zorlu görevlerinden bir tanesidir. Bu amaçla cis, bis ve asimetrik geometride 5,6-di-2-tiyenil-2,3-dihidro¬pirazin içeren üç yeni platin(II) kompleksi sentezlenmiş analizleri tamamlanarak DNA'ya bağlanma kabiliyetleri spektroskopik ve jel elektroforez yöntemleriyle çalışılmıştır. Spektroskopik veriler ve hesaplanan bağlanma sabitleri komplekslerin DNA'ya farklı şekillerde bağlandığını göstermiştir. Cis ve asimetrik kompleksler kovalent etkileşimle bazlara bağlanırken, Bis kompleks DNA ile zayıf ölçüde bir interkalatif etkileşim göstermektedir. Jel elektroforez sonuçları da spektroskopik bulgularla uyum içindedir.Tüm komplekslerDNA'nın çift sarmalında asimetrikten bis komplekse azalan bir sıra ile bir indirgen varlığında (askorbik asit) yükseltgeme yoluyla tek taraflı olarak kırılmaya sebep olmaktadır. Öte yandan, nötr ortamda gerçekleştirilen sitotoksisite deneyleriBis kompleksinin insan beyin hücrelerinde oluşan kanser türüne (Human Glioblastoma) karşı tedavide kullanılabilecek en umut verici antikanser bileşiği olduğunu göstermiştir.