4 results
Search Results
Now showing 1 - 4 of 4
Master Thesis İnsan İdrarları Arasında Gözlenen Çeşitliliğin Yapay İdrar Sistemi ve Ftır Spektroskopisi Kullanılarak Anlaşılması(2023) Ahmed, Marıam Hany Farouk Mohamed; Özkan, Filiz Korkmazİdrar testleri, çeşitli tıbbi bozuklukları tanımlamanın ve teşhis etmenin yaygın ve uygun bir yoludur. Bu çalışmada, 9 yapay idrar bileşeninin normal minimum ve maksimum değerlerinin spektrumunu belirlemek için yeni bir yapay idrar protokolünü (MP-AU) kullanıyoruz. Fourier Transform Infrared (FTIR) spektroskopisi, varsa bozuklukların erken saptanmasına yardımcı olacak bu spektrumları oluşturmak için kullanılmıştır. Hastanın idrar numunesinden elde edilen spektrum, minimum ve maksimum normal değerler için yapay idrar çözeltilerinden elde edilen spektrumlarla karşılaştırılabilir. Bu karşılaştırmanın sonucu hastanın sağlığı ile ilgili olacaktır. Hastanın spektrumu bu iki normal spektrum arasında yer alıyorsa, hastanın sağlık olduğu düşünülebilir. Buna bağlı olarak, hastanın spektrumu normal aralığın dışına çıkarsa, anomaliyi saptamak için daha fazla test istenebilir. Bu çalışmanın bulguları, yapay idrar sistemi içindeki bileşenlerin miktarının, FTIR spektrumundaki tepe noktalarının genlikleri ile ilişkili olduğunu ortaya koymaktadır. Ayrıca, daha sonraki çalışmalarda referans olarak kullanılmak üzere, test edilen idrar bileşenlerinin karakteristik bant pozisyonları da belirlenmiştir. Bu çalışma Atılım Üniversitesi Araştırma Destek programı çerçevesinde ATÜ-ADP-2122-01 numaralı proje ile finansal olarak desteklenmiştir.Master Thesis Gas(x)se(1-x) Katmanlı Karışım Kristallerinin Yapısal ve Elipsometrik Özellikleri(2017) Habaibi, Om-alhana; Işık, Mehmet; Özkan, Filiz KorkmazGaSxSe1-x katmanlı karışım kristalleri yapısal ve optiksel karakterizasyon teknikleri kullanılarak incelendi. Bridgman metodu ile büyütülen örneklerin yapısal karakterizasyonu x-ışını kırınımı (XRD), enerji saçılım spektroskopisi (EDS) ve Fourier transform kızılötesi spektroskopisi teknikleri kullanılarak başarıldı. Karışım kristallerinin kompozisyonal bağımlılığı EDS deneyleri ile elde edildi. Ölçümlerin sonuçları, kullanılan örneklerin x değerinin 0.25 aralıklar ile 0 ile 1 arasında olduğu kompozisyona denk geldiğini gösterdi. Örneklerin kristal yapısı XRD ölçümlerinin sonuçlarını ve analiz için bir yazılım programı kullanarak açığa çıkarıldı. FTIR tayfları x=0, 0.25 ve 0.50 kompozisyonlarındaki örneklerin içerisinde çoklu fonon emiliminin var olduğunu gösterdi. XRD ve FTIR deneylerinin sonuçları kullanılan kompozisyonlar arasında ilişkilendirildi. Örneklerin optiksel karakterizasyonu 1.2-6.0 eV spektral aralıpında gerçekleştirilen elipsometri deneyleri ile tamamlandı. Ölçüm sisteminin çıkış datası optiksel parametrelerin spektraş bağımlılığını gösteren dataya çevrildi. Elipsometrik data örneklerin bant boşluğu enerjilerini elde etmek için kullanıldı. Elde edilen bant enerjisi değerleri karışım kristallerinde sülfür kompozisyonu arttıkça bant enerjisinin 2.4 eV'tan (x = 0) 2.57 eV'a (x = 1) arttığını gösterdi. Ortaya çıkarılan bant enerji değerlerine göre bant boşluğu enerjisinin kompozisyona bağlılığını gösteren bir grafik çizildi.Master Thesis N-(piridin-2-il) metilen benznamine içeren platin(II) kompleksinin sentezi, karakterizasyonu ve spektroskopik yöntemlerle DNA, HSA ve BSA'ya bağlanma davranımları(2017) Abdalla, Rema A İbrahim; Yaman, Şeniz Özalp; Özkan, Filiz KorkmazCisplatinin (Pt(NH3)2Cl2) yapısal analogları DNA ile benzer şekilde etkileştiği için, yeni platin temelli antitümör ilaçlarının, cisplatinden daha aktif olması ve çeşitli nedenlerle oluşabilecek ilaç direncini yenebilmesi beklenilmektedir. Bu amaçla, N-(piridin-2-il)metilen benzamin (L) ligandı içeren PtCl2 kompleksi sentezlenmiş ve karakterizasyonu tamamlanmıştır. Pt(L)Cl2 bileşiğinin buzağı DNA'sı ve serum albumin (BSA ve HSA) ile etkileşimleri test edilmiştir. Pt(L)Cl2 kompleksinin DNA'ya bağlanma mekanizmasını belirleyebilmek için çeşitli spektroskopik yöntemler kullanılmıştır. Platin kompleksi varlığında DNA çözeltisi ile gerçekleştirilen elektronik soğurma spektrumu, termal davranım, viskosite ölçümleri ve florometrik titrasyon deneyleri Pt(L)Cl2'nin DNA ile elektrostatik etkileşim yaptığını kanıtlamıştır. Aynı şekilde, spektroskopik ve viskometrik bulgular Pt(L)Cl2'nin serum proteinleri ile elektrostatik olarak etkileştiğini göstermiştir. Etkileşimin her iki protein için de hidrofobik bölgede olduğu, triptofan etrafında hidrofilite artışı ve alfa heliksler etrafında hidrofilite artışı ile ortaya konulmuştur. Öte yandan sürdürülen detaylı FTIR ölçümlerinden Pt(L)Cl2'nin BSA ya da HSA ile etkileşim noktası husunda net bir bilgi edinilememiştir.Master Thesis 5,6-di(pyridin-2-yl)-2,3-dihydropyrazine Ligand İçeren Yeni Platin(ıı) Kompleksinin Dna ve Bsa'ya Bağlanma Bağlanma Kabiliyetinin Spektroskopik Olarak İncelenmesi(2017) Salem, Asma Mabrouk Mohamed; Yaman, Şeniz Özalp; Özkan, Filiz KorkmazCisplatin kemoterapi tedavisinin yan etkilerinin azaltılması için daha etkin ve daha düşük toksisite değerlerine sahip yeni platin kompleksleri tasarlayarak sentezlerini gerçekleştirmek bu alanda çalışan araştırmacıların ana amacıdır. Bu gaye ile, çalışmamızda cisplatinin yapısal bir benzeri olarak 2,3-bis(2-pyridil)-5,6-dihidropyrazin içeren yeni bir platin kompleksi (PtLCl2) modellenmiş, sentezlenmiş ve yapısal analizleri çeşitli spektroskopik yöntemler kullanılarak tamamlanmıştır. Kompleksin DNA'ya bağlanma tipini belirleyebilmek için UV tirasyon, florometrik titrasyon, termal bozunma ve vizikometri deneyleri fizyolojik artamda yaılmıştır. Termodinamik parametreler yine UV titrasyon deneylerinin farklı sıcaklıklarda yinelenmesi ile elde edilmiştir. Deneyler sonucunda, PtLCl2'nin DNA'nın boşluklarına tutunduğuya da elektrostatik bir etkileşim yaptığı bulunmuştur. PtLCl2'nin BSA ile etkileşimi DNA bağlanma deneylerinde kullanılan yöntemlerle benzer teknikler kullanılarak belirlenmiştir. Sonuçlar kompleksin BSA'ya proteinin hidrofobik bölgesinden bağlanarak hidrofilitesini artırdığını açıkça göstermiştir. Ptotein- kompleks etkileşim alanının belirlenmesi için yapılan ayrıntılı FTIR spektroskopisi analizleri de PtLCl2'nin etkisiyle proteinin hidrofilitesini arttığını doğrular sonuçlar vermiştir.