142 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 142
Article DOĞRUSAL OLMAYAN SINIR KOŞULLARINA SAHİP ISI TRANSFERİ PROBLEMLERİNİN SINIR ELEMAN YÖNTEMİ İLE ANALİZİNE YÖNELİK YENİ BİR FORMÜLASYON(2019) Baranoğlu, BesimBu çalışmada Fourier denklemi ile ifade edilen ısı transferi problemlerinin bir ya da daha fazla bölgesinde tanımlı doğrusal olmayan sınır koşulları altında çözümüne yönelik sınır eleman yöntemi tabanlı etkili bir sayısal çözüm sunulmaktadır. Çözüm, sınır eleman yöntemi sistem matrislerinin üzerinde yapılan matematiksel işlemler ile bilinmeyenleri sadece doğrusal olmayan sınır bölgesindeki sıcaklık farkı olan indirgenmiş matris denklemleri elde etmektedir. Bu sayede doğrusal olmayan sınır koşullarına dayalı iterasyonlar daha hızlı gerçekleştirilebilmektedir. Doğrusal olmayan sınır koşullarının tanımlı olduğu bölgelerde çözüm elde edildikten sonra tüm sınır çözümü tanımlı bir son-işlem ile gerçekleştirilebilmektedir. Gerçek çözümü elde edilmiş bir örnek kullanılarak elde edilen sonuçlar değerlendirilmiştir.Article Alzheimer hastalığında Kallikrein-6, 7 ve potasyum kanal proteinlerinin olası rolü(2021) Bulduk, Erkut; Yıldırım, Filiz; Yıldırım, ZuhalAmaç: Alzheimer hastalığının (AH) oluşum mekanizması kesin olarak bilinmemekle birlikte AH’dan sorumlu başlıca iki protein, senile plakların yapısındaki beta amiloid ve nörofibriler yumakların yapısındaki tau proteinidir. Hastalığa yol açan en önemli etmenlerden biri çözünür olmayan amiloid çökeltilerin oluşumu, diğeri ise artmış tau fosforillenmesidir. Kallikreinler, nöronal hasar ve işlev kaybı ile belirgin AH’nın etiyolojisinde rol oynayan, serin proteazların bir alt familyasıdır. Kallikrein (KLK)-6 ve KLK-7’nin merkezi sinir sisteminde (MSS) yüksek seviyelerde bulunan yaşa bağlı proteaz olduğu bilinmektedir. Daha once AH’ı gibi nörodejeneratif hastalıklarda yer alan hücre dışı proteinlerin proteolizine karıştığı gösterilmiştir. Bu çalışmada KLK-6 ve KLK-7’nin AH patogenezindeki olası rolünü ve potasyum kanal proteinleri arasındaki ilişkiyi araştırmayı amaçladık. Yöntem: Çalışmaya Polatlı Duatepe Devlet Hastanesinde takip edilen yaşları 65’in üzerinde olan 35 AH ve rutin tarama amacıyla nöroloji polikliniğine başvuran kognitif durumu normal olarak değerlendirilen 35 sağlıklı birey (control grubu) dahil edildi. 12 saat açlığı takiben antekübital venden alınan kan örnekleri 4°C’de 2500xg’de 10 dakika santrifüj edilerek, serum örneklerinde KLK-6 ve KLK-7 ile içeri doğru düzeltici potasyum kanalı (KCNJ3) ve iki gözenekli potasyum kanalı (KCNK9) protein düzeyleri enzim-bağımlı immunosorbent assay (ELISA) ile ölçüldü. Gruplar arasındaki fark T-test ile incelendi. p<0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. Bulgular: Gruplar arasında yaş ve cinsiyet açısından bir fark saptanmadı (p>0.05). Alzheimer grubu control grubu ile karşılaştırıldığında serum KLK-6 ve KLK-7 düzeyleri anlamlı olarak artarken (p<0.05), KCNJ3 ve KCNK9 protein düzeylerinde bir fark saptanmadı (p>0.05). Sonuç: Beyinde anormal protein katlanmasının ve birikmesinin önüne geçilememesinin AH’ye yol açtığı düşünülmektedir. Bu araştırmanın bulgularına göre KLK- 6 ve KLK-7 düzeyleri ile AH’nın patolojisi arasında bir ilişki saptandı.Article Citation - WoS: 5Citation - Scopus: 5Covid-19 Infection in Peritoneal Dialysis Patients: \ra Comparative Outcome Study With Patients on \rhemodialysis and Patients Without Kidney Disease(Aves, 2022) Kazancıoğlu, Rümeyza; Ozturk, Savas; Turgutalp, Kenan; Gürsu, Meltem; Arıcı, Mustafa; Oruç, Ayşegül; Ateş, KenanObjectives: There is limited data about coronavirus disease-19 (COVID-19) characteristics and results in peritoneal dialysis \r(PD) patients. This study aimed to investigate the characteristics and outcomes among PD patients and compare them with \rmatched hemodialysis (HD) patients and a control group without kidney disease.\rMethods: We included 18 PD patients and consecutive age- and gender-matched 18 HD and 18 patients without kidney \rdisease (control group) registered into the Turkish Society of Nephrology database including 1301 COVID-19 patients. We \rcompared demographic, clinical, radiological, laboratory data, and outcomes namely intensive care unit (ICU) admission, \rmechanical ventilation, mortality, and composite outcome (death and/or ICU admission).\rResults: ICU admission, mechanical ventilation, and mortality rates in PD patients (27.8%, 22.2%, and 22.2%, respectively) \rand the HD group (16.7%, 11.1%, and 16.7%, respectively) were higher than the control group (11.1%, 11.1%, and 5.6%, \rrespectively), but intergroup comparison did not reveal difference. A total of 11 (20.3%) patients had composite outcome \r(6 PD patients, 3 HD patients, and 2 patients in the control group). In Cox regression analysis, higher age and higher CRP level were related to increased risk of composite outcome. Adjusted rate of composite outcome in PD group was significantly higher than \rthe control group (P = .050). This rate was similar in HD and control groups (P = .30).\rConclusions: Combined in-hospital mortality and/or ICU admission of PD patients with COVID-19 was significantly higher than the control \rpatients. There is a need for careful surveillance of PD patients for infection signs and prompt treatment of COVID-19.Article Citation - WoS: 8Citation - Scopus: 10Nöromüsküler Hastalarda Gövde Kontrolünün Değerlendirilmesi: Gövde Bozukluk Ölçeği’nin Geçerlik ve Güvenirliği(Turkish Neurological Soc, 2018) Demir, Yasemin Parlak; Yıldırım, Sibel AksuAmaç: Çalışmamızın amacı Gövde Bozukluk Ölçeği’nin (GBÖ) erişkin nöromüsküler hastalıklarda geçerlik ve güvenirliğini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya 66 nöromüsküler hastalık tanısı olan birey alındı. Çalışmaya dahil edilen olgulara GBÖ, Manuel Kas Testi (gövde, üst ve alt ekstremite), Motor Fonksiyon Değerlendirme Ölçeği (MFM), Fonksiyonel Bağımsızlık Ölçeği (FIM), Rivermead Mobilite İndeksi (RMI) yapıldı. Bulgular: GBÖ’nün test tekrar test, ICC güvenirlikleri mükemmel bulundu (GBÖ: 0,96 ve 0,98). Cronbach alfa katsayısı 0,82 bulundu. Yapı geçerliği için GBÖ ile MFM (r=0,29), MFM gövde (r=0,31), toplam gövde kas kuvveti (r=0,34), toplam alt ekstremite kas kuvveti (r=0,34, p<0,05), toplam kas kuvveti (gövde, alt ve üst ekstremite) (r=0,52, p<0,05) arasında anlamlı ilişki bulundu. GBÖ uyum geçerliği için FIM (r=0,32, p<0,05) ve RMI (r=0,39, p<0,05) ile ilişkili bulundu. Sonuç: Çalışmanın sonucunda GBÖ’nün erişkin kas hastalıklarında yapı ve uyum geçerliliğinin olduğu ve mükemmel güvenirliğe sahip olduğu bulundu. GBÖ rehabilitasyon kliniklerinde uygulaması kolay ve kısa zaman alan bir ölçektirArticle Citation - WoS: 3Citation - Scopus: 4Semptomatik Çok Ciddi Aort Darlıklı Hastalarda Transkateter Aort Kapak İmplantasyonun Etkisi(Kare Publ, 2021) Karaduman, Bilge Duran; Ayhan, Hüseyin; Keles, Telat; Bozkurt, EnginAmaç: Aort darlığı (AD) ilerleyici bir hastalıktır ve tek tedavi seçeneği olan kapak replasmanı semptomatik hale geldikten sonra ve geri dönüşümsüz miyokardiyal hasar gelişmeden önce yapılmalıdır. Çok ciddi aort darlığı (ÇCAD) hastalarında cerrahi kapak replasmanı asemptomatik olsa bile önerilmektedir. Ancak ÇCAD hastalarında transkateter aortik kapak implantasyonunun (TAVI) etkisi hakkında ayrıntılı bir çalışma yoktur. Bu çalışmada amacımız, semptomatik ÇCAD hastalarında TAVI’nin uygulanabilirliğini ve güvenilirliğini göstermektir. Yöntemler: Merkezimizde TAVI uygulanan toplam 505 ardışık semptomatik AD hastası retrospektif olarak incelendi. Hastaların ortalama yaşı 77.8±7.6 yıl ve %56.4 kadın idi. Hastalar ÇCAD grubu (n: 134 hasta) ve yüksek gradyentli AD grubu (YGAD, n: 371 hasta) olarak iki gruba ayrıldı. Bulgular: ÇCAD grubunda daha fazla kadın cinsiyet, daha yüksek sol ventrikül ejeksiyon (SV) fraksiyonu, daha fazla küçük SV, hipertrofik SV, daha fazla normal koronerler ve daha az koroner arter hastalığı, bypas cerrahisi, miyokard enfarktüsü ve atriyal fibrilasyon öyküsü vardı. Predilatasyon ve Edwards SAPIEN 3 ÇCAD grubunda olarak daha az kullanıldı. VARC-2 kriterlerine göre majör komplikasyonlar ve hastane içi mortalitede (ÇCAD grubu; 5 hasta, YG AD grubu; 16 hasta, p: 0.769) istatistiksel fark saptanmadı. İki grup arasında Cox regresyon modeli sağ kalım eğrisinde ÇCAD lehine istatistiksel olarak anlamlı fark vardı (p<0.001). Sonuç: Bu çalışmamız ile semptomatik çok ciddi aort darlığında TAVI’nin kabul edilebilir komplikasyon ve daha yüksek sağ kalım oranları ile uygulanabilir ve güvenli olduğu gösterilmiştir. Hâlihazırda cerrahi kapak replasmanı endikasyonu olan asemptomatik ÇCAD hastalarında TAVI uygulanabilmesi için daha fazla randomize büyük çalışma gereklidir.Article Citation - WoS: 1Citation - Scopus: 2Cannabinoid Receptor Ligands Modulate Fibrosis and Inflammation in Idiopathic Pulmonary Fibrosis: a Preliminary Study(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2024) Kose, Sevil; Onen, Selin; Gizer, Merve; Boduroglu, Esin; Gonullu, Ugur; Korkusuz, PetekBackground/aim: No specific pharmacological treatment regimen for idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) exists. Therefore, new antiinflammatory therapeutic strategies are needed. Cannabinoids (CBs), known for their inflammation-modulating and antifibrotic effects, may be potential medication candidates for treating IPF. We aim to evaluate the inflammation-modulating and antifibrotic effects of CB receptor (CBR) agonists and antagonists in lipopolysaccharide-stimulated normal human lung fibroblast, epithelial cells, IPF fibroblast cells, and monocytes. Materials and methods: We detected CBRs in normal human lung fibroblasts (LL24) and IPF fibroblast cells (LL29), epithelial cells (A549) and monocytes (THP-1) by flow cytometry. We determined TGF-(31, IL-8, and TNF-alpha inflammatory cytokines in the LL24, LL29, A549, and THP-1 cell culture supernatants on days 1 and 5 by ELISA. We evaluated the cell viability in LL24, LL29, and A549 cells on days 1, 3, and 5 spectrophotometrically and detected collagen Type I (ColI) production in the LL24 and LL29 cell culture supernatants on days 1, 3, and 5 by ELISA. Results: LL24, LL29, A549, and THP-1 cells exhibited CB1 (CB1R) and CB2 (CB2R) receptors. CB1R and CB2R agonists WIN55,2122 and JWH015 inhibited fibroblastic and epithelial cell proliferation on day 5. TGF-(31 and TNF-alpha release increased, while IL-8 release decreased in LL24, LL29, A549, and THP-1 cells in response to the administration of WIN55,212-2 and JWH015 at a 10-2 mM concentration. CB1R and CB2R antagonists AM251 and AM630 did not block agonistic responses, suggesting a nonclassical CBRmediated pathway. CB2R agonist JWH015 decreased ColI expression in IPF lung fibroblasts LL29 on day 3. Conclusion: These results suggest that CB signaling regulates the progression of pulmonary inflammation and fibrosis via CBR activation. This may offer a potential pharmacological tool for developing antifibrosis therapies.Article Kurumsal açık arşivlerin etkin kullanımı: Türkiye'deki bilimsel elektronik yayıncıların görüşleri(2010) Ertürk, Korhan Levent; Küçük, M. Emin1990’lı yıllardan itibaren açık erişim ile ilgili uluslararası düzeyde çalışma ve etkinlikler yapılmış, elektronik yayıncılık modelleri gözden geçirilmiş, üniversite ve bilimsel araştırma kurumlarında kurumsal açık arşivler yapılandırılmıştır. Bilimsel iletişimin en önemli paydaşları olan bilim insanları, bilimsel çalışmalarını Web sayfalarında ve/veya kurumsal açık arşivlerde depolamaya ya da açık erişimli dergilerde yayınlamaya başlamışlardır. Bu çalışma Türkiye’deki bilimsel iletişimin paydaşlarından olan bilimsel elektronik yayıncıların açık erişim farkındalığını belirlemek, kurumsal açık arşivlerin etkin kullanımı konusunda yayıncıların görüşlerini ortaya çıkarmak amacıyla yapılmıştır. Veriler, 101 yayıncıdan anket yoluyla elde edilmiştir. Bulgulara göre yayıncıların büyük bir bölümü (%72) açık erişim farkındalığını edinmiş görünmektedir. Yayıncılar, büyük çoğunlukla (%97) yazarlarının makalelerini kişisel veya kurumsal Web sayfa/sitelerinde herhangi bir zaman diliminde yayınlanmasını destek vermekte. yazarlarının kurumlarında kurumsal açık arşiv yapılandırılması durumunda eserlerinin orijinal sürümü ile konulmasına izin vermektedirler. Sonuç olarak, ülkemizde, kısa bir zaman aralığında kurumsal açık arşivlerde bilimsel içerik arşivlenmesi gerçekleştirilebilecek, işlevselliklerinde artış sağlanabilecektir.Article A Practical Distributed Lightweight Multi-Hop Time Synchronization Algorithm for Linear Wireless Sensor Networks Implemented on a Pic Based System With Realistic Experimental Analysis(Sakarya University, 2020) Erpay, A.; Al Imran, M.A.; Kara, A.Time synchronization is fundamental in the distributed networked systems, especially in Wireless Sensor Networks where a global time is essential to make sense of the events like collection of data and scheduled sleep/wake-up of nodes. There exists numerous time synchronization algorithms and techniques in the literature. Nonetheless, these proposed methods lack realistic experimentation of the synchronization process which is vital from the realization point of view. This study aims to bridge that gap by presenting a distributed lightweight time synchronization protocol implemented on an inexpensive PIC platform. Furthermore, PIC-based systems hadn’t been investigated before and gives an idea of the simplicity of the algorithm. Experimental analysis was done to see the performance of the protocol. The core motivation of the experiments was to the study the impact of the environment (e.g. indoor, outdoors, temperature variations and interference) on the synchronization. Our findings show that temperature indeed impedes the synchronization accuracy. © 2020, Sakarya University. All rights reserved.Article Citation - Scopus: 1The Rise of Artificial Intelligence in Vascular Surgery: a Bibliometric Analysis (2020-2024)(Turkish National Vascular and Endovascular Surgery Society, 2024) Tosun, Burcu; Demirkılıç, UfukAim: This study aims to perform a comprehensive bibliometric analysis of academic publications on AI applications in vascular surgery, identifying key authors, influential journals, prevalent research themes, and international collaborations, focusing on infrastructure, conceptual structure, and social networks within the field.Material and Methods: The analysis covers 815 documents published from 2020 to 2024, retrieved from the Web of Science Core Collection database. Metrics analyzed include publication growth, citation rates, key contributors, leading journals, prevalent themes, and international collaborations.Results: The research output showed a 15% annual growth rate, peaking in 2023. Despite increasing publications, the average citation rate per article declined. The study identified 5039 contributors with significant international co-authorship. Leading authors included Lareyre F and Raffort J, and the \"Journal of Vascular Surgery\" was the most influential journal. The USA and China led in contributions, reflecting robust research infrastructure. Key themes include risk assessment, diagnostic methods, and patient management, highlighting AI's role in enhancing diagnostic accuracy, treatment planning, and patient outcomes in vascular surgery.Conclusion: The analysis highlights the rapid growth and collaborative nature of AI research in vascular surgery. Key contributors, influential journals, and emerging themes were identified, emphasizing AI's role in improving diagnostics and patient outcomes. Limitations include the focus on one database and a five-year period, suggesting future research should include more databases and a longer timeframe. Exploring high-impact studies and practical applications will further advance the field.Conference Object Citation - WoS: 1Citation - Scopus: 1Strong D*2(2460)0 → D+π- Transition in QCD(E D P Sciences, 2014) Sarac, Y.; Azizi, K.; Sundu, H.This work presents the analysis of the transition D*(2)(2460)(0) > D+pi(-). In the calculation three point QCD sum rules method is applied and the value of the coupling constant for the considered vertex is obtained as gD*(2) D pi = (12.72 +/- 3.56) GeV-1.The result of the calculation is also utilized in the decay width and branching ratio calculations of the considered transition.
