Search Results

Now showing 1 - 10 of 11
  • Article
    Neuron Modeling: Estimating the Parameters of a Neuron Model From Neural Spiking Data
    (Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2018) Doruk, Resat Ozgur; Doruk, Ozgur
    We present a modeling study aiming at the estimation of the parameters of a single neuron model from neural spiking data. The model receives a stimulus as input and provides the firing rate of the neuron as output. The neural spiking data will be obtained from point process simulation. The resultant data will be used in parameter estimation based on the inhomogeneous Poisson maximum likelihood method. The model will be stimulated by various forms of stimuli, which are modeled by a Fourier series (FS), exponential functions, and radial basis functions (RBFs). Tabulated results presenting cases with different sample sizes (# of repeated trials), stimulus component sizes (FS and RBF), amplitudes, and frequency ranges (FS) will be presented to validate the approach and provide a means of comparison. The results showed that regardless of the stimulus type, the most effective parameter on the estimation performance appears to be the sample size. In addition, the lowest variance of the estimates is obtained when a Fourier series stimulus is applied in the estimation.
  • Article
    Citation - WoS: 1
    Citation - Scopus: 1
    Anticipatory Effect of Execution on Observation: an Approach Using Exopinch Finger Robot
    (Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Arıkan, Kutluk Bilge; Zadeh, Hassan Gol Mohammad; Turgut, Ali Emre; Zinnuroğlu, Murat; Bayer, Gözde; Günendi, Zafer; Cengiz, Bülent
    Background/aim: This study aims to explore the mirror neuron system (MNS) involvement using mu (8–12 Hz)/beta (15–25 Hz) bandsuppression in an action observation-execution paradigm.Materials and methods: Electrophysiological (EEG) data from 16 electrodes were recorded while 8 participants observed video clips ofa hand squeezing a spring. Specifically, the effect of anticipated execution on observation was studied. For this purpose, a fully actuatedfinger exoskeleton robot was utilized to synchronize observation and execution and to control the execution condition for the participants. Anticipatory effect was created with a randomized robot accompany session.Results: The results showed that the observational condition (with or without anticipation) interacted with hemisphere at central channels near somatosensory cortex. Additionally, we explored the response of MNS on the kinetics features of visual stimuli (hard or softspring).Conclusion: The results showed an interaction effect of kinetics features and hemisphere at frontal channels corresponding nearly tothe ventral premotor cortex area of the brain. The activation of mirror neurons in this area plays a crucial role in observational learning.Based on our results, we propose that specific type of visual stimuli can be combined with the functional abilities of the MNS in the action observation based treatment of hand motor dysfunction of stroke patients to have a positive additional impact.
  • Article
    Citation - WoS: 8
    Citation - Scopus: 10
    Nöromüsküler Hastalarda Gövde Kontrolünün Değerlendirilmesi: Gövde Bozukluk Ölçeği’nin Geçerlik ve Güvenirliği
    (Turkish Neurological Soc, 2018) Demir, Yasemin Parlak; Yıldırım, Sibel Aksu
    Amaç: Çalışmamızın amacı Gövde Bozukluk Ölçeği’nin (GBÖ) erişkin nöromüsküler hastalıklarda geçerlik ve güvenirliğini araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya 66 nöromüsküler hastalık tanısı olan birey alındı. Çalışmaya dahil edilen olgulara GBÖ, Manuel Kas Testi (gövde, üst ve alt ekstremite), Motor Fonksiyon Değerlendirme Ölçeği (MFM), Fonksiyonel Bağımsızlık Ölçeği (FIM), Rivermead Mobilite İndeksi (RMI) yapıldı. Bulgular: GBÖ’nün test tekrar test, ICC güvenirlikleri mükemmel bulundu (GBÖ: 0,96 ve 0,98). Cronbach alfa katsayısı 0,82 bulundu. Yapı geçerliği için GBÖ ile MFM (r=0,29), MFM gövde (r=0,31), toplam gövde kas kuvveti (r=0,34), toplam alt ekstremite kas kuvveti (r=0,34, p<0,05), toplam kas kuvveti (gövde, alt ve üst ekstremite) (r=0,52, p<0,05) arasında anlamlı ilişki bulundu. GBÖ uyum geçerliği için FIM (r=0,32, p<0,05) ve RMI (r=0,39, p<0,05) ile ilişkili bulundu. Sonuç: Çalışmanın sonucunda GBÖ’nün erişkin kas hastalıklarında yapı ve uyum geçerliliğinin olduğu ve mükemmel güvenirliğe sahip olduğu bulundu. GBÖ rehabilitasyon kliniklerinde uygulaması kolay ve kısa zaman alan bir ölçektir
  • Article
    Citation - WoS: 4
    Citation - Scopus: 4
    Neuroprotective effects of adrenomedullin in experimental traumatic brain injury model in rats
    (Turkish Assoc Trauma Emergency Surgery, 2022) Emmez, Gokcen; Bulduk, Erkut Baha; Yildirim, Zuhal
    BACKGROUND: Traumatic brain injuries cause damages in the brain in several ways, which include cell death because of edema, disruption of the blood-brain barrier, shear stress, and ischemia. In this study, we investigated the effects of adrenomedullin (AM) on oxidative stress and inflammation after head traumas in a rat model. METHODS: Eighteen male adult Wistar albino rats were randomized into three groups (n=6). No traumas were applied to the control (C) group. Traumas were applied in line with Marmarau trauma model in the trauma group. The rats in the AM treatment group were treated with post-traumatic 12 mu g/kg i.p. AM in addition to the trauma group. The rats were followed for 7 days in all groups and were then sacrificed. Brain tissues and blood samples were taken. RESULTS: In the trauma group, both tissue and serum MDA, TNF-alpha, and IL-6 levels were significantly increased compared to the control group (p<0.05). In the AM-treated group, serum TNF-alpha levels were significantly decreased compared to the trauma group (p<0.05). In the trauma group, both tissue and serum GSH levels were significantly decreased compared to the control group (p<0.05). In the trauma group, serum Vitamin D3 levels were significantly decreased compared to the control group (p<0.05). In the AM-treated group, both tissue and serum GSH levels were significantly increased compared to the trauma group (p<0.05). CONCLUSION: These results indicate that AM has neuroprotective effects on traumatic brain injury in a rat model.
  • Article
    Bası Yaralarında Bakım Verenlerin Hastalıkla İlgili Farkındalık Düzeyi
    (2023) Seyhan, Nevra; Dursun, Ali Doğan
    Amaç: Bası yaralarında hastaların birebir bakımını üstlenen kişiler hastaya etkili ve kaliteli bakım sağlayabilmeleri için hastalıkla ilgili yeterli bilgi sahibi olmalıdır. Bu çalışmanın amacı bası yarası hastalarına bakım verenlerin hastalıkla ilgili bilgi seviyesini ve farkındalık derecesini belirlemektir. Gereç ve Yöntemler: Sağlık Bakanlığı Evde sağlık hizmetleri birimi bünyesinde takip ve tedavisi yapılan 120 bası yarası hastasına birebir bakım verenler çalışmaya dahil edilmiştir. Bakım verme süresi 1 yıldan az olanlar çalışmaya dahil edilmemiştir. Bakım verenlere sosyo-demografik özelliklerini ve bası yaraları hakkındaki bilgi ve farkındalık düzeylerini belirlemeye yönelik 10 sorudan oluşan anket uygulandı. Bulgular: Bası yarası bakımı yapan kişilerin yaş ortalaması 40,57 idi (min 19-maks 74). Bakım verenle- rin %76,7’sinin (92 kişi) eğitim seviyesi ortaokul ve altındaydı. Bakım verenlerin bası yaralarına yönelik bilgi düzeylerinin ortalaması 43,33±13,68 puan olarak belirlendi. Bası yarası bakımı yapan kişilerin bilgi ve farkındalık düzeyi ortalama puanı, toplam puan ortalamasının (50 puan) altındaydı. Anket sorularına verilen doğru cevap oranları düşüktü. Bası yarası bakımı yapan kişilerin cinsiyet ve yaşlarına göre bası yarasına ilişkin bilgi ve farkındalık düzeyleri arasında anlamlı farklılık görülmedi (p>0,05),ancak bakım verme süresi ile bilgi ve farkındalık düzeyleri arasında anlamlı fark bulunmaktaydı(p<0,05). Sonuç: Bu çalışmada katılımcıların bası yarasına ilişkin bilgi ve farkındalık düzeylerinin düşük olduğu görülmüştür. Bakım verenlerin hastalık hakkındaki bilgi seviyesinin yeterli olması; dekubit ülseri oluşumunu önlemede ve tedavi süresince başarılı sonuçlar elde etmede etkili olduğu için, bu bakımı veren kişilerin eğitiminin önem arz ettiği değerlendirilmektedir.
  • Review
    Kafa Travmasında Rehabilitasyon
    (2020) Bulduk, Erkut; Ercan, Serdar
    Travmatik beyin hasarı (TBH), 21. yüzyılda dünya genelinde önemini devam ettiren global bir sağlık sorunudur. Hastanın ve ailesininyaşamını ciddi bir şekilde etkileyen, birden fazla tıbbi, bilişsel, davranışsal, ekonomik ve sosyal sonuçlara yol açan TBH’da ilkhedef hasarın önlenmesidir. Hasar geliştikten sonra etkisini sınırlandırmak, fonksiyonel iyileşmeyi hızlandırmak ve artırmak içinmultidisipliner nörorehabilitasyon çok önemlidir. Kafa travması ile ilişkili çok sayıda tıbbi, bilişsel ve davranışsal sorunlar dikkatledeğerlendirilmeli ve topluma yeniden entegrasyon olasılığını artırmak için her bireye özel tedavi planlanması çok önemlidir. Sonuçolarak nörorehabilitasyon sürekli olarak gelişen bir alandır. Beynin iyileşme yeteneği hakkında daha fazla bilgi edindikçe, yeniterapötik müdahaleler ve rehabilitasyon teorileri ortaya çıkacaktır.
  • Article
    Alzheimer Hastalığında Kallikrein-6, 7 ve Potasyum Kanal Proteinlerinin Olası Rolü
    (2021) Bulduk, Erkut Baha; Yıldırım, Zuhal; Yıldırım, Filiz
    Objective: Although the formation mechanism of Alzheimer’s Disease (AD) is not known with certainty, two major proteins, beta amyloid of senile plaques and tau protein of neurofibrillary tangels are responsible for AD. One of the major factors in the development of the disease is the formation of in soluble amyloid deposits, and the other one is the increased tau phosphorylation. Kallikreins (KLK’s) are a sub-family of serine proteases that play a role in the etiology of AD which is characterized by neuronal damage and loss of function.Kallikrein (KLK)-6 and KLK-7 are known to be age-related protease and are found at high levels in the central nervous system (CNS). It was previously shown to be involved in proteolysis of extracellular proteins implicated in neurodegenerative diseases such as AD. In this study, we aimed to investigate the possible role of KLK-6 and KLK-7 in the pathogenesis of AD and the relationship between potassium channel proteins. Methods: A total of 35 Alzheimer’s patients over the age 65 years, followed-up by Polatlı Duatepe Government Hospital and 35 healthy individuals (control group) admitted to the neurology clinic for routine screening with cognitive status considered normal were included in this study. After a 12-hour hunger, KLK-6 and KLK-7 were measured with inwardly rectifying potassium channel protein (KCNJ3), and two-pore potassium channel protein (KCNK9) levels were measured by the Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay (ELISA) in the serum of the blood samples which were taken from the antecubital vein after centrifuging for 10 minutes at 2500xg. The differences between the two groups were tested by T- test. A value of p<0.05 was considered statistically significant. Results: All the groups were matched for age and gender, but not statistically significant difference was observed (p>0.05). According to our findings, serum KLK- 6 and KLK-7 levels of Alzheimer’s group were significantly increased (p<0.05). A significant difference was not detected when the levels of serum KCNJ3 and KCNK9 of the Alzheimer’s group compared with the control group (p>0.05). Conclusion: It is thought that the failure in preventing the abnormal protein folding and accumulation leads to AD in the brain. According to the findings of the present study, a positive correlation was detected between the levels of KLK-6 and KLK-7 and AD’s pathology.
  • Article
    İnsan Kafasındaki Dokuların Öziletkenliklerin Kestirimi İçin Kullanılan İstatistiksel Kısıtlı Minimum Ortalama Hatalar Karesi Algoritmasının Kaynak Yerelleştirimine Etkisi
    (2012) Şengül, Gökhan; Baysal, Uğur
    EEG ve/veya MEG ölçümleri verildiğinde, insan beynindeki aktif kaynakların bulunması\"EEG/MEG biyoelektromanyetik ters problemi\", \"aktivite kaynağının belirlenmesi\" ya da\"kaynak yerelleştirimi\" (source localization) olarak tanımlanır. Tipik bir kaynak yerelleştirimisistemi EEG/MEG ölçümlerinin yanısıra hastanın/deneğin kafasına ait geometri bilgisine,elektriksel kaynak hakkındaki ön bilgiye, ölçüm elektrotlarının sayısına ve bu elektrotların üçboyutlu uzaydaki konumuna ve kafa modelinde yer alan dokularınöziletkenliklerine/özdirençlerine ihtiyaç duyar. Bu çalışmada insan kafasındaki dokularınöziletkenliklerini kestirmek için daha önce önerilen İstatistiksel Kısıtlı Minimum OrtalamaHatalar Karesi algoritmasının, öziletkenlik kestirimindeki başarımı benzetim çalışmaları ilehesaplanmış ve kaynak yerelleştirimine etkisi araştırılmıştır. Beyin, kafa tası ve kafaderisinden oluşan üç kompartımanlı gerçekçi bir kafa modeli kullanılarak yapılan benzetimçalışmalarında 100 farklı öziletkenlik değeri kestirilmeye çalışılmış ve kestirim hataları kafaderisi için ortalamada %23, kafatası için % 40 ve beyin için de %17 olarak hesaplanmıştır.Çalışmanın ikinci bölümünde ise literatürde verilen ortalama öziletkenlik değerlerikullanıldığında ve önerilen algoritma ile kestirilen öziletkenlik değerleri kullanıldığındaortaya çıkan kaynak yerelleştirimi hataları yine benzetim çalışmaları ile araştırılmıştır.Çalışma sonunda literatürde verilen ortalama öziletkenlik değerleri kullanıldığında 10,1 mmkaynak yerelleştirimi hatası bulunurken önerilen algoritma ile kestirilen öziletkenlik değerlerikullanıldığında ise bu hata 2,7 mm'ye inmiştir. Burada bulunan sonuçlara göre İ.K.M.O.H.K.algoritması ile kestirilen doku öziletkenlikleri kullanıldığında kaynak yerelleştirimi konumhatasında ortalama öziletkenlik kullanılması durumuna göre %73,07'lik azalmagörülmektedir. Sonuç olarak kaynak yerelleştirimi uygulamalarında İ.K.M.O.H.K. algoritmasıile kişiye özgü olarak elde edilen doku öziletkenliklerini kullanmak, ortalama öziletkenlikkullamaya kıyasla hata oranlarını azalttığı sonucuna varılabilir.
  • Article
    Early Impairment of Right Ventricular Functions in Patients With Moderate Asthma and the Role of Isovolumic Acceleration
    (2022) Karasu, Betül Banu; Ayhan, Hüseyin; Ayhan, Hüseyin; Ayhan, Hüseyin
    Introduction: Asthma is a common chronic lung disease that affects people all over the world. Pulmonary hyper- tension and right ventricular (RV) dysfunction are possible complications that may develop in the advanced stages of asthma. However, the number of studies investigating asthma and its implications on new RV parameters are very rare. This study aims to evaluate the RV functions in patients with moderate asthma before the development of pulmonary hypertension. Patients and Methods: Forty-one patients with moderate asthma and 40 healthy individuals were enrolled in this case-control study. All participants underwent a detailed two-dimensional echocardiographic examina- tion. RV functions were measured through RV isovolumic acceleration (IVA) index in addition to conven- tional parameters. RV IVA, a tissue doppler derived parameter, was calculated as the ratio between maximum isovolumic myocardial velocity during isovolumic contraction and the time interval from the onset of this wave to the time at its maximum velocity. Results: There were no significant differences between the two groups in terms of baseline clinical character- istics, laboratory findings and echocardiographic parameters measuring left ventricular functions (p> 0.05). In asthmatic patients, RV isovolumic relaxation time and RV myocardial performance index were higher (p= 0.027 and p< 0.001 respectively), while RV fractional area change, tricuspid annular plane systolic excur- sion (TAPSE) and RV IVA values were all lower (p< 0.001). RV IVA was found to be inversely proportional to asthma duration. TAPSE [β= 0.632, 95% CI= (0.121) - (0.225), p< 0.001] and pulmonary artery systolic pressure [β= -0.188, 95% CI= (-0.057) - (-0.003), p= 0.032] were shown as independent predictors of RV IVA. Conclusion: Asthma is an important disease that may result in subclinical RV dysfunction even before the development of pulmonary hypertension. RV IVA, an easily obtained and load-independent parameter, may be a useful and reliable index that sensitively analyzes subtle deteriorations in the contractile function of RV in asthmatic patients. RV IVA may also correlate with asthma duration.