TR-Dizin
Permanent URI for this collectionhttps://ada.atilim.edu.tr/handle/123456789/21
Browse
Browsing TR-Dizin by Scopus Q "Q3"
Now showing 1 - 20 of 37
- Results Per Page
- Sort Options
Article Citation Count: 016S Bacterial Metagenomic Analysis of Herby Cheese (Otlu Peynir) Microbiota(Istanbul Univ-cerrahpasa, 2021) Sudağıdan, Mert; Yurt, Mediha Nur Zafer; Taşbaşı, Behiye Büşra; Acar, Elif Esma; Ömeroğlu, Esra Ersoy; Uçak, Samet; Aydın, AliCheese microbiota may contain various bacterial species due to the use of different types of milk, rennet, and herbs. In this study, the distribution of the dominant bacteria present in the microbiota of herby cheese samples (n = 13) were examined by the next generation sequencing (NGS) technique. DNA was extracted both directly from cheese samples and after pre-enrichment. The metagenomic analysis of the NGS results revealed that Firmicutes were dominant both in DNA directly extracted from herby cheese (KOP), and pre-enriched samples (OP), at the phylum level. At the genus level, Lactobacillus, Lactococcus, and Streptococcus were dominant in the KOP samples, whereas in the OP samples, Enterococcus, Streptococcus, and Bacillus were determined as the dominant bacterial genera. Although Lactococcus raffinolactis and Streptococcus salivarius were dominant in the KOP samples, Enterococcus faecalis and S. salivarius were dominant in the OP samples. The Shannon species diversity index and principal coordinates analysis (PCoA) were used to determine the distribution in KOP and OP samples at the genus level. The PCoA of KOP-10, KOP-11, KOP-2, and KOP-7, KOP-3, and KOP-6 samples showed the wide distribution, whereas KOP-5, KOP-8, KOP-9, and KOP-14 herby cheese samples were closely related. The OP samples, especially OP-7 and OP-14, showed wide distribution in comparison to other OP samples. Finally, the dominant bacterial communities were identified by DNAbased metagenomic analysis, and this is the first report to elucidate the microbiota of herby cheese produced in Turkey using the NGS technique.Article Citation Count: 0An adaptive element division algorithm for accurate evaluation of singular and near singular integrals in 3D(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2021) Yazıcı, Ali; Baranoglu, Besim; Baranoğlu, Besim; Software Engineering; Manufacturing EngineeringAn adaptive algorithm for evaluation of singular and near singular integrals in 3D is presented. The algorithm is based on successive adaptive/selective subdivisions of the element until a prescribed error criteria is met. For evaluating the integrals in each subdivision, Gauss quadrature is applied. The method is computationally simple, memory efficient and can be applied for both triangular and quadrilateral elements, including the elements with nonplanar and/or curved surfaces. To assess the method, several examples are discussed. It has shown that the algorithm performs well for singular and near-singular integral examples presented in the paper and evaluates the integrals with very high accuracy.Article Citation Count: 0ANN-assisted forecasting of adsorption efficiency to remove heavy metals(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Balku, Şaziye; Balku, Şaziye; Özalp Yaman, Şeniz; Energy Systems Engineering; Chemical EngineeringIn wastewater treatment, scientific and practical models utilizing numerical computational techniques suchas artificial neural networks (ANNs) can significantly help to improve the process as a whole through adsorption systems.In the modeling of the adsorption efficiency for heavy metals from wastewater, some kinetic models have been used such as pseudo first-order and second-order. The present work develops an ANN model to forecast the adsorption efficiency of heavy metals such as zinc, nickel, and copper by extracting experimental data from three case studies. To do this, we apply trial-and-error to find the most ideal ANN settings, the efficiency of which is determined by mean square error (MSE) and coefficient of determination (R2). According to the results, the model can forecast adsorption efficiency percent (AE%) with a tangent sigmoid transfer function (tansig) in the hidden layer with 10 neurons and a linear transferfunction (purelin) in the output layer. Furthermore, the Levenberg–Marquardt algorithm is seen to be most ideal for training the algorithm for the case studies, with the lowest MSE and high R2 . In addition, the experimental results and the results predicted by the model with the ANN were found to be highly compatible with each other.Article Citation Count: 0An approach for performance prediction of saturated brushed permanent magnet\rdirect current (DC) motor from physical dimensions(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2022) Ertan, Hulusi Bülent; Asl, Rasul Tarvirdilu; Zeinali, Reza; Ertan, Hulusi Bulent; Electrical-Electronics EngineeringAn analytical approach for performance prediction of saturated brushed permanent magnet direct current\r(DC) motors is proposed in this paper. In case of a heavy saturation in the stator back core of electrical machines, some\rflux completes its path through the surrounding air, and the conventional equivalent circuit cannot be used anymore.\rThis issue has not been addressed in the literature. The importance of considering the effect of the flux penetrating\rthe surrounding air is shown in this paper using finite element simulations and experimental results, and an analytical\rapproach is proposed to consider this effect on magnet operating point determination and performance prediction of\rsaturated brushed permanent magnet DC motors. An analytical method is also presented to determine the boundary\rradius of the surrounding air for obtaining accurate results in finite element (FE) solutions and analytical calculations.\rAn analytical approach based on Carter’s coefficient is also proposed to calculate the effective length of the magnet when\rthe length of the magnet and rotor length are not the same. The accuracy of the proposed analytical model is illustrated\rusing finite element simulations and experimental results. With this accuracy, this analytical model is very suitable to\rbe used for reliable and quick mathematical design optimization.Article Citation Count: 0Bozucu torklar altında izdüşümsel doğru akım motoru kontrolü(Gazi Univ, Fac Engineering Architecture, 2018) Doruk, Reşat Özgür; Doruk, Reşat Özgür; Zuglam, İsmail; Electrical-Electronics EngineeringBu çalışmada, izdüşümsel doğrusal kareselservo geri beslemesi (P-LQSF) yöntemiyle tasarlanmış bir birdoğru akım (DC) motoru denetim yaklaşımı sunulmaktadır. Tasarlanan denetleyicinin kararlılığı girdidenhale-kararlılıkyaklaşımından yola çıkarak incelenmektedir. İzdüşümsel kontrol yöntemi, tam durumdeğişkeni geri beslemeli bir denetleyicinin özdeğer spektrumunu çıktı geri beslemesi kullanarak yaklaşıkolarak elde etmeyi amaçlar. Tasarlanan denetleyicilerin kararlılık analizi hem teorik hem de sayısalbenzetim yoluyla incelenecektir. Temel doğrusal kararlılığın yanı sıra, bozucu etkilerin kapalı döngüyü birdış girdi olarak etkilemesinden yola çıkarak girdiden-çıktıya-kararlılık kavramından yararlanılması olanaklıolabilmektedir. Sonuç olarak bir bozucu etkiden-hale-kararlılık yaklaşımı ortaya çıkmaktadır. Tasarımlar,elde edilen bu yaklaşımla incelenecektir. Performanslar ise sayısal benzetimler yoluyla görülecektir.Article Citation Count: 2Characterization of mesenchymal stem cells in mucolipidosis type II (I-cell disease)(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Köse, Sevil; Kaya, Fatima Aerts; Kuşkonmaz, Bülent Barış; Çetinkaya, Duygu Uçkan; Nutrition and DieteticsMucolipidosis type II (ML-II, I-cell disease) is a fatal inherited lysosomal storage disease caused by a deficiency of theenzyme N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase. A characteristic skeletal phenotype is one of the many clinical manifestationsof ML-II. Since the mechanisms underlying these skeletal defects in ML-II are not completely understood, we hypothesized that adefect in osteogenic differentiation of ML-II bone marrow mesenchymal stem cells (BM-MSCs) might be responsible for this skeletalphenotype. Here, we assessed and characterized the cellular phenotype of BM-MSCs from a ML-II patient before (BBMT) and afterBM transplantation (ABMT), and we compared the results with BM-MSCs from a carrier and a healthy donor. Morphologically, wedid not observe differences in ML-II BBMT and ABMT or carrier MSCs in terms of size or granularity. Osteogenic differentiation wasnot markedly affected by disease or carrier status. Adipogenic differentiation was increased in BBMT ML-II MSCs, but chondrogenicdifferentiation was decreased in both BBMT and ABMT ML-II MSCs. Immunophenotypically no significant differences were observedbetween the samples. Interestingly, the proliferative capacity of BBMT and ABMT ML-II MSCs was increased in comparison to MSCsfrom age-matched healthy donors. These data suggest that MSCs are not likely to cause the skeletal phenotype observed in ML-II, butthey may contribute to the pathogenesis of ML-II as a result of lysosomal storage-induced pathology.Article Citation Count: 0Comparison of Three Different Learning Methods of Multilayer Perceptron Neural Network for Wind Speed Forecasting(Gazi Univ, 2021) Tora, Hakan; Tora, Hakan; Buaisha, Dr.magdi; Airframe and Powerplant MaintenanceIn the world, electric power is the highest need for high prosperity and comfortable living standards. The security of energy supply is an essential concept in national energy management. Therefore, ensuring the security of electricity supply requires accurate estimates of electricity demand. The share of electricity generation from renewables is significantly growing in the world. This kind of energy types are dependent on weather conditions as the wind and solar energies. There are two vital requirements to locate and measure specific systems to utilize wind power: modelling and forecasting of the wind velocity. To this end, using only 4 years of measured meteorological data, the present research attempts to estimate the related speed of wind within the Libyan Mediterranean coast with the help of ANN (artificial neural networking) with three different learning algorithms, which are Levenberg-Marquardt, Bayesian Regularization and Scaled Conjugate Gradient. Conclusions reached in this study show that wind speed can be estimated within acceptable limits using a limited set of meteorological data. In the results obtained, it was seen that the SCG algorithm gave better results in tests in this study with less data.Article Citation Count: 0Correlation of clinical signs and magnetic resonance imaging findings in patients with lumbar spondylosis(Turkish League Against Rheumatism, 2023) Altan, Lale; Ökmen, Burcu Metin; Tuncer, Tiraje; Sindel, Dilşad; Çay, Hasan Fatih; Hepgüler, Simin; Uğurlu, HaticeObjectives: The purpose of the study was to contribute further to this debated topic by investigating the correlation of magnetic resonance imaging (MRI) findings with the clinical picture in lumbar spondylosis patients. Patients and methods: This multicenter retrospective study (as part of the epidemiological project of the TLAR-OASG [Turkish League Against Rheumatism-Osteoarthritis Study Group]) included 514 patients (101 males, 413 females; mean age: 63.6±10.8 years; range, 40 to 85 years) who were diagnosed as lumbar spondylosis by clinical examination and direct X-ray between December 2016 and June 2018. Demographic characteristics of patients, Visual Analog Scale for pain, presence of radiating pain, Roland-Morris disability questionnaire, straight leg raise test, deep tendon reflexes, neurogenic intermittent claudication symptoms, any decrease of muscle strength, and abnormality of sensation were recorded. Lumbar MRI findings of the patients were recorded as positive or negative in terms of disc herniation, intervertebral disc degeneration, root compression, osteophytes, spinal stenosis. Statistical analysis was done to assess the correlation between the clinical symptoms, physical examination, and MRI findings. Results: Correlation analysis of the MRI results and the clinical findings showed a significant correlation between straight leg raise test and root compression (p<0.001, r=0.328) and a significant correlation between neurogenic intermittent claudication and spinal stenosis (p<0.001, r=0.376). Roland-Morris disability questionnaire had a significant correlation with all MRI findings (p<0.05, r<0.200). Conclusion: The results of this study corroborate the notion that diligent patient history and physical examination are more valuable than MRI findings, even though a higher incidence of abnormal MRI findings have been obtained in patients with disability and dermatomal radiating pain.Article Citation Count: 1Diplotaxis tenuifolia ve Reseda lutea Metanol Özütünün Antioksidan Savunma Sistemi Enzimleri ve Aldoz Redüktaz Aktivitesi Üzerinde Olan Etkisinin İncelenmesi(Turkish Pharmacists Assoc, 2018) İşgör, Sultan Belgin; Abdalrahman, Khalid Sharro; Güneş, Merve Gülşah; Shomalı, Naznoosh; İşgör, Belgin Sultan; Yıldırım, Özlem; Chemical EngineeringAmaç: Bu çalışmada Diplotaxis tenuifolia ve Reseda lutea’nın çiçek ve yapraklarından elde edilmiş olan metanol özütlerinin AR, CAT, GST ve GPx enzimlerinin aktiviteleri üzerinde olan etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, bitki örneklerinin toplam fenolik ve flavonoid içeriği; Folin-Ciocalteu ve alüminyum klorür reaktiflerinin yardımıyla kolorimetrik yöntemlerle değerlendirilmiştir. Ayrıca özütlerin CAT, GST, GPx ve AR enzimlerinin aktiviteleri üzerindeki etkileri kinetik analizler ile araştırılmıştır. Bulgular: En yüksek miktarda fenolik ve flavanoid içeriği sırasıyla 144.49±0.29 mg gallik asit eş değeri/L ve 250.485±0.002 quercetin eş değeri/L tespit edilmiştir. GST ve GPx için en iyi aktivite profilleri sırasıyla 121±0.05 ve 140±0.001 ng/mL IC50 değerleri ile D. tenuifolia yaprak özütünde gözlemlenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre, R. lutea ve D. tenuifolia’nın yapraklarından elde edilen metanol özütleri, AR enzimi üzerinde önemli ölçüde bir aktivite potansiyeli göstermemiştir. Bununla beraber, çalışılmış olan çiçek ve yaprak özütlerinin hiçbiri yeterli düzeyde CAT aktivasyonu gösterememiştir. Sonuç: Çalışma sonucunda, D. tenuifolia’nın yapraklarının antioksidan enzimatik savunma sistemi üzerinde iyi bir etkiye sahip olduğu gösterilmiştir. Bu sebeple günlük diyet için iyi bir besin kaynağı olarak kabul edilebilir.Article Citation Count: 4Elektrik direnç punta kaynağı ile birleştirilen %15 deforme edilmiş TWIP çeliğinde kaynak akımının mikroyapı ve mekanik özellikler üzerindeki etkisi(Gazi Univ, Fac Engineering Architecture, 2020) Davut, Kemal; Tutar, Mümin; Su, Bayram Ali; Bayram, Ali; Department of Metallurgical and Materials Engineering; Industrial EngineeringÇalışmada, %15 deforme edilmiş TWIP saclarının elektrik direnç punta kaynağıyla birleştirmelerindekaynak akımının mikroyapı ve mekanik özellikler üzerindeki etkisi incelenmiştir. Mikroyapıkarakterizasyonunda optik mikroskop, taramalı elektron mikroskobu (SEM), SEM/Enerji dağılımlı X-ışınıSpektroskopisi (SEM-EDS) ve SEM/Elektron Geri Saçılım Kırınımı (SEM-EBSD) teknikleri kullanılmıştır.Mekanik özelliklerin belirlenmesinde, mikrosertlik ölçümleri ve çekme testleri yapılmıştır. Kaynak akımıartışı ile erime bölgesindeki kaynak boşlukları azalırken, çekirdek çapı, çökme miktarı ve ısı tesiri altındakibölge (ITAB) genişliği yaklaşık lineer bir şekilde artmıştır. Kaynak bölgesinde deformasyon ikizleri ortadankalkarken, ITAB’da iri tavlama ikizleri ortaya çıkmıştır. Ayrıca, kaynak akımı artışıyla ITAB’daki taneirileşmesi ve ikiz kalınlıkları artmıştır. Ancak, kaynak işlemi kaynak bölgesinde herhangi bir fazdönüşümüne neden olmamıştır. Bu sebeple, kaynak bölgesi sertlik değerleri temel malzemenin sertlikdeğerlerinden oldukça düşük kalmıştır. Genel itibariyle, en düşük sertlikler ITAB’da gözlenmiştir. Kaynakakımı ile kaynak bölgesi sertlik değerleri arasında herhangi bir korelasyon elde edilmemiştir. Kopma yükükaynak akımı ile artmıştır: En yüksek kopma yükü 10 kA kaynak akımında elde edilmiştir. Düşük kaynakakımlarında aryüzey tipi kırılma meydana gelirken yüksek kaynak akımlarında buton çekirdek tipi kırılmalarortaya çıkmıştır. Kırılma karakteristikleri genel itibariyle gevrek-sünek karışımıdır. Daha yüksekmukavemete sahip numunelerde gevrek-sünek kırılma bölgesinde sünek kırılma, gevrek kırılma bölgesindeise trans-granular kırılma karakteristikleri artış göstermiştir.Article Citation Count: 2ERGENEKON DESTANI’NDAN TOPLUMSAL BİLİNÇDIŞINA YANSIYAN ANNE, ATEŞ VE HAYVAN İMGELERİ(Geleneksel Yayincilik Ltd Stl, 2023) Ulus, Gökçe; Department of Social Sciences for University wide Coursesİlk insanın doğada kendine yer edinebilmesi, nereden geldiği ve nereye ait olduğu bilgisine erişme ça- bası; varoluşsal gereklilik olarak anlama, anlatma ihtiyacıyla birleşir. Bu ihtiyaç doğrultusunda ilk hayaller imgelere ve söze dönüşür. İmgeler, insanın kendini tanımlamasında araç olur. Milleti fark etmeksizin bireyle- rin sorduğu “Ben kimim?” sorusuna verilen ilk cevaplar mitlerdir. Toplumsal değerlerin aktarıcısı olan mitler üzerinden, imgelerin ışığında toplumsal kimlik okumaları yapılabilir. İmge ait olduğu toplumu; değerleri, sanatı, folkloruyla kavranılır kılar. Bu gücüyle folklorik imgelem, Jung’un sınırlarını netleştirdiği ortak bi- linçdışına büyük bir kapı açılmasını sağlar. Toplumsal bilinçdışında Jung’un arketipleri ilk örnekleri oluşturur. İmgeler üzerinden arketiplerin değerlere yansıması okunabilir. Türk halk bilimi bu konuda çok büyük bir hazineye sahiptir. Mevcut metinler Türk tarihini, Türk kimliğini çok yönlü bir biçimde ortaya koyar. Ana metni günümüze ulaşamasa da Ergenekon Destanı Türkler için kültürel bir mirastır. Milletin hayatta kalması için savaşması, bireyin hayatta kalması için beslenmesi gereği karşısında, coğrafya temelli bu metindeki imgeler üzerinden psikanalitik bir okuma denemesi yapılmaktadır. Orhan Ural’ın “Ergenekon Destanı” özet metni diğer özet metinlerle karşılaştırılmış ve bu çalışmaya referans alınmıştır. Ergenekon Destanı ifadesiyle kastedilen metin bu olacaktır. Bu anlatıda Türklerin yeniden doğuşu, tarih sahnesinde tekrar yer almaları imgesel olarak anlatılır. Geçmişten günümüze farklı özet metinlerle ulaşan Ergenekon Destanı’ndaki imgeleri tespit etmek kültürümüze dair okumaları derinleştirecektir. Anne arketipinin imgeye dönmesinin aslında Türklere ait bazı millî değerlerin yansıması olduğu fark edilmiştir. Ergenekon Destanı Göktürklerin güç kaybı ve düzen değiştirmesi gibi olumsuzluklarla başlar. Sonrasında mücadele, doğa karşısında konumlanma, ateş ve hayvan imgeleriyle devam eder. Ateş imgesi günümüze kadar farklı ritüellerde temel simge ve kutsiyet ifadesi olarak kullanılmıştır. Bunun altında yatan nedenler Ergenekon Destanı’nda arandığında (farklı okuma- lar mümkün olmakla birlikte) arınmaya ve babanın izine gönderme olabilir. Su anneyle, ateş de babayla bağdaştırılarak okunduğunda canlılık ve güç imgeleri de yerini bulur. Ateşe yüklenen kutsiyet gibi, hayvanlar- la ilişkinin de Türk kimliğinin neresinde olduğu merak edilmiştir. Hayvanlarla özdeşimin farklı yansımaları Ergenekon Destanı’nda kurt, at, ceylan ve diğer av hayvanları üzerinden izlenip onların destanda hangi değer- leri karşıladığı incelenmiştir. Hayvanlara yüklenen değerlerle günümüzde Türk kültürünün farklı ögelerinde bu değerlerin yaşatıldığı fark edilmiştir. Bazı imgeler Türklerin beslenme algılarını, mutfak kültürünü bile yönetecek kadar toplumsal hafızaya kazınmıştır. Kolektif bilinçdışı fertlerden bağımsız değildir ve Ergenekon Destanı’nda öne çıkan imgeler de Türklerin kolektif bilinçdışını yansıtır. Üstelik dilde ve anlatılarda varlığını hissettiren değerler, toplumsal cinsiyet rolleri için de önemlidir. Aynı doğrultuda toplumsal bilinçdışının izleri Ergenekon Destanı ışığında aranmış, tespit edilen izlekler Jung’un teorisi ve imgelem unsurlarından referans alınarak okunmaya çalışılmıştır. Bu kuramsal temele dayanarak yapılmaya çalışılan çıkarımlar Türk kültürün- deki millî ve ferdî değerlerle karşılaştırılmıştır.Article Citation Count: 8Evaluation of procedural and clinical outcomes of transcatheter aortic valve implantation: A single-center experience(Kare Publ, 2020) Karaduman, Bilge Duran; Kayaoğlu, Hüseyin Ayhan; Keleş, Telat; Bozkurt, EnginObjective: Transcatheter aortic valve implantation (TAVI) is an established alternative to surgical aortic valve replacement. Our study aimed to evaluate the implementation of TAVI at our large-volume center, having an all-comer patient population with short and long-term follow-ups. Methods: This retrospective, single-center analysis included 556 consecutive patients with symptomatic severe aortic stenosis (AS) who underwent TAVI between July 2011 and December 2019. Results: The mean age of the entire population was 77.6±7.9 years, and 54.9% were women. The Society of Thoracic Surgeons (STS) mean score of the cohort was 6.0%±3.5%. The balloon-expandable valve (Sapien XT, Sapien 3; Edwards Lifesciences, Irvine, California) was the most frequently used valves in this cohort (94.6%). Transfemoral access was used in 96.3% of patients. Implantation success was achieved in 96.6% of cases. During the TAVI procedure, 7.2% of patients required permanent pacemaker implantation, with 37.5% in the Lotus valve group needing the most permanent pacemakers. The mean length of hospital stay for the entire cohort was 4.5±2.3 days. Overall, 22 (3.9%) in-hospital deaths occurred before hospital discharge. The mean follow-up period was 15.1±14.9 months for all patients, and a significant improvement was noted in all echocardiographic parameters and functional capacity. Paravalvular leak (PVL) was documented in 18.9% patients, mild in 17.9%, and moderate in 1% at discharge. No cases with severe PVL, necessitating additional procedures. The multiple logistic regression analysis revealed that sex, STS score, baseline SYNTAX score, bicuspid valve morphology, common femoral artery diameter, and post-TAVI PVL were independent predictors of overall mortality. Conclusion: To our knowledge, this study, which is the largest single-center real-world experience of TAVI in Turkey, demonstrated low complication rates with favorable short- and mid-term THV performance in patients undergoing TAVI.Article Citation Count: 0FAIR prensipleriyle uyumlu gözlemlenebilen ve izlenebilen sosyal medya tabanlı dijital habercilik veri modeli(Gazi Univ, Fac Engineering Architecture, 2024) Takan, Savaş; Takan, Duygu ErgünGünümüzde artan veri dolaşımı nedeniyle dijital habercilikte bilgi kirliliği ve dezenformasyon daha önce hiç olmadığı kadar yaygın hale gelmiştir. Eski tarihlerde bilgiye erişim bir hak olarak vurgulanırken, günümüzde bilgi kirliliğinden korunma hakkı ortaya çıkmıştır. Bunun en temel nedeni, dijital ortamda dolaşıma giren çok sayıda haberin takibinin yapılamaması ve dijital haber paylaşımının gerektirdiği sorumlulukları düzenleyecek bir yapının bulunmamasıdır. Bu gibi problemlerin çözümüne yönelik çalışmamızda dijital habercilik veri modeli geliştirilmiştir. Dijital habercilik için önerdiğimiz veri modeli, FAIR prensiplerini sağlamasının yanı sıra, haberlerin birbiriyle mantıksal ilişkiye sahip olmasını ve haberlerin tüm süreçleriyle takip edilebilir olmasını mümkün kılarak, güvenilir bir sosyal medya ağı oluşturur. Herhangi bir veri modelinin gözlemlenebilen ve izlenebilen bir sosyal medya ortamını destekleyebilmesi için, büyük verileri barındıran çizge yapılarıyla çalışabilmesi gerekmektedir. Mevcut blokzinciri teknolojileri, gözlemleyebilme ve izleyebilme özelliklerini sağlasa da bu teknolojiler sosyal medya ağının gerektirdiği çizge veri yapısını desteklememektedir. Bu problemleri çözmek için, önerdiğimiz yapıda model ile veri birbirinden ayrılmış ve indeksleme mekanizmalarının desteklenmesi sağlanmıştır. Önerilen veri modeli, blokzinciri teknolojisinin veri modeli ile karşılaştırılmış ve sonuçta, dijital habercilik için geliştirdiğimiz modelin zaman ve alan karmaşıklığının yanı sıra, sürdürülebilirlik ve bakım maliyetleri açısından blokzinciri teknolojisinin veri modeline göre daha uygun olduğu tespit edilmiştir.Article Citation Count: 0Fitting a recurrent dynamical neural network to neural spiking data: tackling the sigmoidal gain function issues(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Doruk, Reşat Özgür; Doruk, Reşat Özgür; Electrical-Electronics EngineeringThis is a continuation of a recent study (Doruk RO, Zhang K. Fitting of dynamic recurrent neural networkmodels to sensory stimulus-response data. J Biol Phys 2018; 44: 449-469), where a continuous time dynamical recurrentneural network is fitted to neural spiking data. In this research, we address the issues arising from the inclusion ofsigmoidal gain function parameters to the estimation algorithm. The neural spiking data will be obtained from the samemodel as that of Doruk and Zhang, but we propose a different model for identification. This will also be a continuoustime recurrent neural network, but with generic sigmoidal gains. The simulation framework and estimation algorithmsare kept similar to that of Doruk and Zhang so that we can have a solid base to compare the results. We evaluatethe estimation performance in two different ways. First, we compare the firing rate responses of the original and theestimated model. We find that responses of both models to the same stimuli are similar. Secondly, we evaluate variationsof the standard deviations of the estimates against a number of samples and stimulus parameters. They show a similarpattern to that of Doruk and Zhang. We thus conclude that our model serves as a reasonable alternative provided thatfiring rate is the response of interest (to any stimulus).Article Citation Count: 0Giulio Mongeri’nin Erken Cumhuriyet Dönemi Yapısı Eskişehir Ziraat Bankası’nın Kültürel Miras Yönetimi Kapsamında İncelenmesi(Istanbul Univ, Research inst Turkology, dept Art History, 2020) Temel, Rabia; Pfeıffer-taş, Şule; Pfeiffer Taş, Şule; Fine Arts and Elective CoursesEskişehir Ziraat Bankası Binası, Giulio Mongeri’nin (1873-1951) Erken Cumhuriyet Dönemi’nde Anadolu’da tasarladığışubeler arasındadır. Kent kimliğinin simge yapılarından olup Birinci Ulusal Mimarlık olarak adlandırılan dönemin özelliklerinitaşımaktadır.Ziraat Bankası’nın (kuruluş 1888), Eskişehir’de bir şube açmak için arazi tahsisi talebi 1906-1907’deki yazışmalardanizlenebilmektedir. Binanın yapımına 1928 yılında başlanabilmiş, açılışı Cumhuriyet’in kuruluşunun yedinci yıl dönümünde 29Ekim 1930’da gerçekleşmiştir. 1978 yılında bu bina yıkılmak istenmiş, 1979 yılında, 1930 yılı öncesine ait Cumhuriyet DönemiYapısı olması nedeniyle Korunması Gerekli Taşınmaz Kültür Varlığı olarak tescillenmiştir. 2005’te Koruma Grubu I (bir)kategorisine alınmıştır. Zaman içinde çeşitli müdahaleler geçirmiştir ancak öncesinde restitüsyon araştırması yapılmamasınedeniyle değişikliklerin izlenmesi zorlaşmaktadır.Çalışma, arşivlerden derlenen belgeler, çizimler, eski fotoğraflar vb. ışığında yapıdaki değişimlerin izini sürerek ve diğeryapılarla karşılaştırarak özgün mimari ve sanatsal öğeleri ortaya koymayı amaçlamaktadır. Mongeri’nin Ziraat BankasıEskişehir Şube Binası’nda, akımın özelliklerini yansıttığı tasarım unsurları ve dönem içindeki değeri irdelenmektedir.Bulgular, Mongeri’nin akımın özelliklerini cephe düzenlemesinde, giriş ve müşteri holü iç mekân tasarımında, Bursakemeri, mukarnas, hatayi, rumi vb. Selçuklu-Osmanlı unsurlarını da kullanarak günümüze kadar yansıttığını göstermektedir.Giriş kapısındaki değişiklik, özgün mobilyaların günümüze ulaşamaması, iç mekânda kapı yapılması, teknoloji bağlantılıdeğişiklikler gibi nedenlerle bütüncül değeri azalsa da, yapı Birinci Ulusal Mimarlık akımı özelliklerini korumaktadır.Article Citation Count: 0Gold-assembled silica-coated cobalt nanoparticles as efficient magnetic separation units and surface-enhanced Raman scattering substrate Lütfiye Sezen YILDIRIM1,, Murat KAYA2,∗,, Mürvet VOLKAN(Tubitak Scientific & Technological Research Council Turkey, 2019) Kaya, Murat; Yıldırım, Lütfiye Sezen; Kaya, Murat; Volkan, Mürvet; Chemical EngineeringMagnetic and optical bifunctional nanoparticles that combine easy separation, preconcentration, and efficientSERS capabilities have been fabricated with high sensitivity and reproducibility through a low-cost method. Thesegold nanoparticles attached on magnetic silica-coated cobalt nanospheres (Co@SiO2 /AuNPs) display the advantageof strong resonance absorption due to gaps at nanoscale between neighboring metal nanoparticles bringing large fieldenhancements, known as “hot spots”. The prepared particles can be controlled by using an external magnetic field,which makes them very promising candidates in biological applications and Raman spectroscopic analysis of dissolvedorganic species. The magnetic property of the prepared particles lowers the detection limits through preconcentrationwith solid-phase extraction in SERS analysis. The performance of the prepared nanostructures was evaluated as a SERSsubstrate using brilliant cresyl blue (BCB) and rhodamine 6G (R6G) as model compounds. The solid-phase affinityextraction of 4-mercapto benzoic acid (4-MBA) using bifunctional Co@SiO2 /AuNPs nanoparticles followed by magneticseparation and the measurement of the SERS signal on the same magnetic particles without elution were investigated.Approximately 50-fold increase in SERS intensity was achieved through solid-phase extraction of 8.3 × 10 −6 M 4-MBAin 10 min.Publication Citation Count: 0How to define 30-day mortality?(2021) Karaduman, Bilge Duran; Ayhan, Hüseyin; Karaduman, Bilge Duran; Ayhan, Hüseyin; Keles, Telat; Bozkurt, Engin-Article Citation Count: 0Identification of Bacterial Diversity of Bee Collected Pollen and Bee Bread Microbiota by Metagenomic Analysis(Aves, 2022) Özalp, Veli Cengiz; Yurt, Mediha Nur Zafer; Tasbasi, Behiye Busra; Acar, Elif Esma; Yegin, Zeynep; Ozalp, Veli Cengiz; Sudagidan, Mert; Basic SciencesThis study investigated the bacterial diversities of bee-collected pollen and bee bread of Apis mellifera in Turkey. The bacterial community structure of 14 bee pollen from Bingol, Konya, and Hakkari and 11 bee bread samples from Bingol were studied using 16 S rRNA amplicon sequencing and metagenomic analysis. The dominant bacterial phylum in pollen and bee bread samples was Firmicutes, followed by Proteobacteria. In pollen and bee bread samples, Bacillaceae, Clostridiaceae, Enterococcaceae, and Enterobacteriaceae were identified as dominant bacterial families. At the genus level, Bacillus, Clostridium sensu stricto, and Enterococcus were dominant bacteria in both pollen and bee bread samples. The most abundant species was Clostridium perfringens in both pollen and bee bread samples. Escherichia vulneris, Enterococcus faecalis, Bacillus cereus, Enterococcus casseliflavus, and Cronobacter malonaticus were identified with high reads in pollen samples. In bee bread samples, E. faecalis, Clostridium bifermentans, and Pantoea calida were abundant bacterial species. Alpha diversity showed that pol-3 sample had the highest diversity. Beta-diversity plots separated the pollen samples into four main groups and bee bread samples into three main groups. Our results indicated that the culture-independent metagenomic analysis will be a valuable tool for determining the microbial diversity of bee products produced in Bingol-Turkey one of the important centers of apiculture.Article Citation Count: 0İki boyutlu doğrusal tek tip hücresel özdevinirlerin başlangıç durum yoğunluklarını dikkate alan sözde rastgele sayı üretimlerinin başarım analizi(Gazi Univ, Fac Engineering Architecture, 2024) Kılıç, Hürevren; Kılıç, Hürevren; Computer EngineeringBu çalışmada, iki boyutlu doğrusal tek tip hücresel özdevinirlerin başlangıç durum yoğunluklarının sözde-rastgele sayı üretimlerine olan etkisi deneysel olarak incelenmiştir. Geliştirilen yaklaşım, hücresel özdevinirlerin kaliteli sözde-rastgele sayı üretimlerinde başlangıç durum yoğunluklarının dikkate alması açısından özgündür. Deneylerde 512 adet iki boyutlu doğrusal hücresel özdevinir (DHÖ) değerleri 0,05 ile 0,95 arasında değişen 19 adet farklı başlangıç durum yoğunlukları (ρ) için (toplam 512*19 = 9728 adet) incelenmiştir. Sayı dizisi üretimlerini takiben deneylerin ilk aşamasında söz konusu DHÖ’ler literatürde bilinen rastgele sayı üreteçleriyle birlikte National Institute of Standards and Technology (NIST) istatistiksel test süiti testlerine tabi tutulmuştur. İkinci aşamada ise, ilk aşamadaki NIST testlerinden başarılı olarak geçen 7 adet farklı yoğunluktaki hücresel özdevinire ve literatürde bilinen üreteçlere AIS31 ve TestU01 test süitlerinde yer alan testler uygulanmıştır. Yapılan karşılaştırmalı çalışma neticesinde, rastgele sayı üretimlerinde başarılı olan 2D doğrusal hücresel özdevinir üreteçlerin doğrudan kriptografik amaçlı uygulamalar için kullanımlarının uygun olmadığı, özellikle literatürde yer alan zorlu (stringent) testlerden olan TestU01 testlerinin uygulanması neticesinde görülmüştür. Bu netice literatürde bilinen sonuçları desteklemektedir. Öte yandan 9728 adet özdevinire uygulanan NIST testleri neticesinde alınan sonuçlara göre özdevinirlerin başlangıç durum yoğunluk oranlarının sözde rastgele sayı üretimlerini etkilemektedir ve literatürde dikkate alınmayan bu durum özdevinir tabanlı sözde rastgele sayı üretimi araştırmalarında dikkate alınmalıdır.Article Citation Count: 0Impact of coronary revascularization on outcomesof transcatheter aortic valve implantation(Aves, 2021) Karaduman, Bilge Duran; Ayhan, Hüseyin; Keles, Telat; Bozkurt, EnginObjective: Although the effect of coronary revascularization on clinical outcomes before and after transcatheter valve implantation (TAVI) is debatable, there is currently insufficient data to determine the most appropriate revascularization strategy. In this study, we present our single-center experience of percutaneous coronary intervention (PCI) and its effect on clinical outcomes and mortality in patients undergoing TAVI.Methods: We performed a retrospective analysis of 526 consecutive patients at our center, and 127 patients with obstructive coronary artery disease were included in the study. Patients were divided into two groups: the revascularization group (group 1) and the non-revascularization group (group 2). Procedural complications and long-term all-cause mortality rates were compared between the two groups.Results: Of the 526 patients, group 1 comprised 65 patients (12.3%) who underwent PCI, and group 2 comprised 62 patients (11.7%) who did not undergo revascularization. According to Valve Academic Research Consortium 2 criteria, post-procedural complications, including pericardial effusion, stroke, major vascular complications, major bleeding, and emerging arrhythmias, were similar between the groups. A Kaplan–Meier survival curve analysis showed no significant difference between the revascularization and non-revascularization groups (Overall: 40.0±2.8 month; 95% CI 34.4-45.6 month, p=0.959). After adjustment for basal SYNTAX score, chronic kidney disease stage, previous myocardial infarction, and baseline troponin levels, the long-term survival of group 1 was significantly longer when compared with group 2 (p=0.036). In 75.4% of cases, PCI was performed within 11.0±14.7 days before or after TAVI as a staged procedure. In 13.8% of cases, PCI was performed simultaneously with TAVI. While there was no significant difference in in-hospital, 6-month, and 1-year mortality rates between the simultaneous and staged PCI groups, there was a significant difference in 30-day mortality (11.1% vs. 0%, respectively; p=0.016).Conclusion: Peri-procedural and long-term safety outcomes and mortality rates are not significantly different between revascularized and non-revascularized patients, and neither staged nor simultaneous PCI have adverse outcomes in patients undergoing TAVI.