Browsing by Author "İşgör, Sultan Belgin"
Now showing 1 - 20 of 44
- Results Per Page
- Sort Options
Conference Object Citation Count: 0Aldose reductase natural inhibitors from ethyl acetate extracts from southern Turkey(Taylor & Francis inc, 2010) Onay, Melih; Coruh, Nursen; Isgor, Belgin; Chemical Engineering[No Abstract Available]Master Thesis Algınate mıkroskurelerı ve ilaç taşıyıcı olarak nanokurelerın sentezi için karşılaştırmalı calısmalar(2018) Alzawı, Hana M.hamad; İşgör, Sultan Belgin; İşgör, Yasemin Gülgün; Chemical EngineeringÇalışmanın amacı, alginat mikrosferleri ve nanosferlerin sentezi için kullanılan yöntemleri karşılaştırmak ve ilaç dağıtımında gelecekte kullanılacak aljinat parçacıklarının en iyi boyut ve küresel şeklini elde etmektir. Bu amaçla dört grup yöntem uygulandı, her yöntem grubuna aynı protokol bazı değişikliklerle takip edildi. Birinci grubun altı metodu iki tip yüzey aktif cismi arasında mukayese edildi ve aynı zamanda aljinat ile surfaktan arasındaki oran da karşılaştırıldı. Ayrıca, aljinat, yüzey aktif madde ve çapraz bağlayıcıların karıştırma süresi ve konsantrasyonları ile ikinci gruptaki yedi yöntem karşılaştırıldı. Üçüncü çalışma grubunda, düşük viskozite yerine alginat orta viskozitesinin kullanımını karşılaştıran ve çapraz bağlayıcı (CaCl2% 46, CaCl2% 60, MnCl2% 60, ZnCl2% 60) farklı tür ve konsantrasyon kullanmaya çalışan dört yöntem vardır. Çalışmamızın son grubu, iki tip polivinil alkolün (düşük molekül ağırlıklı ve yüksek moleküler ağırlıklı) ve çapraz bağlayıcıların farklı türlerini (CaCl2% 60, MnCl2% 60, ZnCl2% 60) karşılaştıran altı yöntem içeriyor. Laboratuvarımızda yirmi üç yöntemden elde edilen en iyi sonuç, alginat% 1 (düşük viskozite) ile PVA% 2 (düşük moleküler ağırlıklı) kullanıldığında hazırlanan aljinat mikrosferlerin çapı 5μm olan dördüncü grubun ilk yöntemi idi), AOT %5 ve kalsiyum klorür % 60.Master Thesis Antihipertansif kalsiyum kanalı bloker ilaçlarının biyokimyasal analizi(2017) Maged, Mustafa; İşgör, Sultan Belgin; İşgör, Yasemin Gülgün; Chemical EngineeringBirçok çalışma kalsiyum kanal önleyici ilaçların, özellikle Diltiazem ve Verapamil'in kanser riski veya kemoterapötik ilaç etkinliği ile aralarında bağ bulunduğunu ortaya koymuştur. Bu çalışmada, piyasada varolan ilaçlardan diltiazem ve verapamil'in antioksidan enzimler; Süperoksit Dismutaz (SOD), Katalaz (CAT), Glutatyon Peroksidaz (GPx), ve Glutatyon-s-tramsferaz (GST) üzerine olan etkileri ve bu yolla kanser gelişimi veya kemoterapötik ilaç direnci ile ilişkileri, bildiğimiz kadarıyla literatürde ilk defa test edilmiştir. Bu çalışmada ilaçların çözünürlüğü, belli miktardaki ilaçların su, methanol ve fosfat tamponu (100 mM, pH 6.5) gibi farklı çözücülerle çalışılmıştır. En yüksek çözünürlüğün fosfat tamponuyla bulunması nedeniyle kararlılık testleri bu çözücüyle gerçekleştirilmiştir. Kararlılık testlerinde ilaç ekstreleri 4ºC de saklanmış ve günlük olarak diltiazem için 236 nm ve verapamil için 278 nm dalgaboyunda absorpsiyon ölçümleri yapılmıştır. İlaçların ikisinin de 49 gün boyunca 4ºC'de kararlı olduğu bulunmuştur. Enzim aktivitelerine olan etkileri ilaçların farklı dozlarında analiz edilmiş ve sonuçlar kontrole kıyasla inhibisyon yüzdesi olarak verilmiştir. Sonuçların ortaya koyduğu biçimiyle Diltiazem ve Verapamil SOD enziminin faaliyetini yaklaşık %90 oranında arttırmıştır. İlaçların GST üzerindeki etkisi; Verapamil için enzim aktivitesi %100 oranında artarken, Diltiazem %22'den düşük inhibisyon yaptığıdır. GPx için sonuçlar Diltiazem'in %90, Verapamil'in ise %100 oranında inhibisyon yaptığı şeklindedir. Diğer yandan CAT enzimi ile yapılan çalışmaların sonucunda Diltiazem ve Verapamil'in herhangi bir önemli etkiye yol açmadığı görülmüştür.Master Thesis Asetilkolin esteraz inhibitörleri biyokimyasal analizi gibi piyasada bulunan antihipertensif ilaçlar: Kaptopril and lisinopril(2018) Elbanna, Ahmed Eıd Abdelbasset Abdallah Elbanna; İşgör, Sultan Belgin; İşgör, Yasemin Gülgün; Chemical EngineeringAsetilkolin esteraz inhibitörleri kemoterapötik ilaç direnci veya kanser gelişimiyle ilişkisi merak edici bir konudur.Bunula ilgili belli bir kanıtlama yoktur. Bu çalışmada, ilk defa laboratuvarda seçilmiş ACE inhibitörlerin ilaçlarının şu enzimler üzerine etkisini incelemekteyiz: Super Oxide Dismutaz (SOD), Catalaz (CAT), Glutathione Peroxidaz (GPx) ve Glutathione-S- Transferaz (GST). Bunun yanında, ilaçların çözünürlüğü ve istikrarı belli koşullar altında muhaveze edilğinde uğradığı değişimler tespit edilmektedir Sodium phosphate tamponlar ve PH:6.5 ve 7 kullanılmıştır. İlaçlar ise +4 C ve -20C derecede muhavaze edimiştir. 30 gün boyunca ilaçlar hiç bir değişikliğe uğramamıştır ( enzim denemesini yapmak için gereken süredir). Kaptopril SOD enzimini 98% GST enzimi 85% orantıyla, CAT enzimi ise sadece 5% ve GPx enzimini 11% orantıyla engellemiştir. Ancak Lisinopril SOD enzymi 99% orantıyla, GST enzimi 98% orantıyla, CAT enzimi ise 70% ve GPx enzimini 53% orantyla engellemiştir.Article Citation Count: 9Benchmarking Classification Models for Cell Viability on Novel Cancer Image Datasets(Bentham Science Publ Ltd, 2019) Ozkan, Akin; Isgor, Sultan Belgin; Sengul, Gokhan; Isgor, Yasemin Gulgun; Chemical Engineering; Computer Engineering; Department of Electrical & Electronics EngineeringBackground: Dye-exclusion based cell viability analysis has been broadly used in cell biology including anticancer drug discovery studies. Viability analysis refers to the whole decision making process for the distinction of dead cells from live ones. Basically, cell culture samples are dyed with a special stain called trypan blue, so that the dead cells are selectively colored to darkish. This distinction provides critical information that may be used to expose influences of the studied drug on considering cell culture including cancer. Examiner's experience and tiredness substantially affect the consistency throughout the manual observation of cell viability. The unsteady results of cell viability may end up with biased experimental results accordingly. Therefore, a machine learning based automated decision-making procedure is inevitably needed to improve consistency of the cell viability analysis. Objective: In this study, we investigate various combinations of classifiers and feature extractors (i.e. classification models) to maximize the performance of computer vision-based viability analysis. Method: The classification models are tested on novel hemocytometer image datasets which contain two types of cancer cell images, namely, caucasian promyelocytic leukemia (HL60), and chronic myelogenous leukemia (K562). Results: From the experimental results, k-Nearest Neighbor (KNN) and Random Forest (RF) by combining Local Phase Quantization (LPQ) achieve the lowest misclassification rates that are 0.031 and 0.082, respectively. Conclusion: The experimental results show that KNN and RF with LPQ can be powerful alternatives to the conventional manual cell viability analysis. Also, the collected datasets are released from the "biochem.atilim.edu.tr/datasets/ " web address publically to academic studies.Doctoral Thesis Bilgisayarlı görme ve makine öğrenme'ye dayalı olarak trapan mavisi boya dışlama tabanlı ışık mikroskoplarının otomatize hücre sayarına uyarlanabilir dönüşüm yöntemi(2017) Özkan, Akın; İşgör, Sultan Belgin; Şengül, Gökhan; Department of Electrical & Electronics Engineering; Chemical EngineeringHücre biyolojisi deneylerinin hemen hemen hepsi, hücre çoğalmasını ve yaşayabilirliğini izlemek için düzenli olarak hücrelerin sayımını içerir. Hücrenin miktarı ve kalitesinin bilgisi, deneysel standardizasyon ve toksisite etkisi tahmini için önemli parametrelerdir. Hücreleri saymak için hemositometre tabanlı elle sayma ve otomatik hücre sayacının kullanımı gibi iki farklı yaklaşım vardır. Yöntemlerden her ikisinin de avantajları ve dezavantajları vardır. Yüksek yatırım ve operasyonel maliyet otomatik hücre sayaçlarının geniş kullanımını sınırlar. Öte yandan, hemositometreye dayalı manuel hücre sayımı, hücre sayımının güvenilirliğinin, operatörün deneyimine ve yorgunluğuna büyük ölçüde bağlı olduğu gerçeği ile çeşitli sınırlamaları vardır. . Uzun zaman gereksinimi ve insan işgücü elle işleme sürecinin iki dezavantajı olarak sayılabilir. Bu tez, görüntü işleme ve makine öğrenmeyi esas alan dönüştürme metodolojisini tanımlayarak hücre sayımı için en gelişmiş alternatif metodu (çerçeve iskeleti) önermektedir. Önerilen yöntemin temelini, eksikliklerini azaltmak için ara katman karar yazılımı ekleyerek elle sayım yöntemine hemocytomer tabanlı otomatik saymanın uyarlanmasıdır. Buna ek olarak, önerilen yöntemimizi hücre sayımı (boyasız) ve hücre yaşayabilirliği analizi (boyalı) açısından test etmek için iki yeni veri seti toplanmıştır. Bu veri kümeleri, 'biyokimyasal.atilim.edu.tr/datasets/' adresinden kâr amacı gütmeyen herkesin kullanımına sunulmaktadır ve bu da bu araştırma alanındaki gelecek çalışmalara temel teşkil edecektir. Her iki veri kümesi, iki farklı türde kanser hücresi görüntüsü, yani, beyaz renkli promiyelositik lösemi (HL60) ve kronik miyelojenik lösemi (K562) içerir. Deneysel sonuçlarımızdan yola çıkarak, yöntemimiz HL60 ve K562 kanser hücreleri için sırasıyla geri çağırma skorları açısından % 92 ve % 74'e kadar ulaşmaktadır. Deney sonuçları, önerilen yöntemin mevcut hücre sayımı yaklaşımlarına güçlü bir alternatif olabileceğini de doğrular.Master Thesis Birleşik ilaç tedavisinin HL60 hücreleri üzerine etkisi(2019) Aljadı, Hanan Salem Saıd; İşgör, Sultan Belgin; İşgör, Yasemin Gülgün; Chemical EngineeringÖnceki çalışmalar, başka bir ilacın sinerjistik etkisine bağlı olarak bir ilacın etkinliğini artırarak ve ilaca karşı direncin üstesinden gelmekle birlikte, çeşitli kanserlerin tedavisinde ilaç kombinasyonunun kullanılmasının avantajlarını göstermiştir. Bu çalışmada tek başına ve kombinasyon halinde farklı ilaçlar kullanılmıştır. Bu ilaçlar, antihipertansif ilaç olarak kullanılan ve son zamanlarda antitümör ilaç olarak kullanılan selektif adrenerjik reseptör olan Doxazosin Mesilat'tır. Bir diğer ilaç, Genistein, farklı kanser türlerini tedavi etmek için kullanılan doğal bir antikanser ilacıdır. Son olarak hem sağlıklı hem de kanser hücrelerinde yüksek toksisiteye sahip güçlü bir antikanser ilacı olan SU6656 aynı zamanda bu çalışmanın toksisite kontrolü olarak kullanılmıştır. Bu çalışmada tek başına veya kombinasyon halinde kullanılan ilaçların insan lösemi hücrelerinin (HL60) hücre büyümesi ve antioksidan enzimler Glutatyon-S-transferaz (GST) ve Superoksit Dismutaz (SOD) üzerindeki etkilerini araştırıp bu hücrelerin Protein Tirozin Kinazın (PTK) aktivitesi üzerine de etkileri de çalışılmıştır. Bu çalışmada ilk olarak, insan lösemi hücre hatları kullanılarak, her ilacın farklı konsantrasyonları tek olarak ve daha sonra farklı kombine ilaç konsantrasyonları tabi tutularak ilaç etkileri araştırıldı., her ilacın kendisi ve ilaç kombinasyonunun hücre canlılılığı üzerine etkisi tripan mavisi metodu kullanılarak yapıldı. Doksazosin mesilatın, genistein ve SU6656 ile karşılaştırıldığında insan lösemi hücrelerinin (HL60) büyümesinde daha az toksik etkisi olduğu görüldü. Ortaya çıkan sonuçlar göstermiştir ki, 0.312 uM genistein ile 7.5 uM doksazosin mesilat kombinasyonunda, antikanser ilaç genisteinin sitotoksik etkisi önemli ölçüde artmıştır. SU6656'nın insan lösemi hücrelerinde daha toksik etkisi olduğu bulunmuştur. Bu çalışmada kullanılan ilaçların etkisinin PTK enziminin aktivitesine ek olarak GST ve SOD antioksidan enzimlerinin aktivitesinin ölçülmesi bu enzimlerin kaynağı olarak kullanılan insan lösemi hücrelerinin kullanılmasıyla gerçekleşmiştir. Enzim sonuçları, Doxazosin mesilat ve genisteinin, tek başına veya kombinasyon halinde GST aktivitesini inhibe ettiğini, SU6656'nın ise GST aktivitesini indüklediğini göstermiştir. Doksazosin mesilat ve SU6656, SOD enziminin aktivitesini indüklerken, tek başına doxazosin mesilat ile kombinasyon halinde genisten, HL60 hücrelerinin SOD aktivitesini inhibe etmiştir. Protein tirozin kinazın aktivitesi, tek başına ya da genistein ile kombinasyon halinde doksazosin mesilat ile indüklenmiştir. Genistein sadece daha yüksek dozlarda PTK aktivitesini ve en düşük dozlarda PTK aktivitesini indüklemiştir. Tek başına SU6656 ve doksazosin mesilat ile kombinasyon halinde PTK aktivitesini inhibe etmiştir.Article Citation Count: 2Cellular Defense Enzyme Profile for Non-cytotoxic and Phenol Enriched Extracts of Heliotropium europaeum, Carlina oligocephala and Echinops ritro(Asian Network Scientific information-ansinet, 2018) Isgor, Belgin S.; Isgor, Yasemin G.; Geven, Fatmagul; Chemical EngineeringBackground and Objective:The discovery of traditional plants with some medicinal properties, verifying their biological targets and the bioassay guided standardization of their active components are the particular interest of diverse research groups recently. These efforts may help to revise the therapy modalities with natural product supplements. In this context, the possible biological targets of plants, namely Heliotropium europaeum, Carlina oligocephala and Echinops ritro, with no known medicinal value but recognized for their region specific traditional use, were evaluated. Here, the biological targets were enzymes of the antioxidant and xenobiotic defense mechanisms, with roles on inflammatory response. Materials and Methods: Cytotoxicity analyses were performed by using human promyelocytic (HL60) and chronic myelogenous leukemia (K562) cells for circulating models and breastadenocarcinoma (MCF7) cells for epithelial model to evaluate the non-toxic dose range of extracts by virtue of XTT and trypan blue. The target aimed effectiveness of these plants were determined with dose response profiles and IC50 values against glutathione peroxidase (GPX), glutathione transferase(GST),catalase (CAT) and superoxide dismutase (SOD) targets, as well as their capacity to reduce free radicals (DPPH) and non-radical hydrogen peroxide (H2O2). For standardization purposes, all extract concentrations were brought to 23.81 mg L-1 GAE and dilutions were made from these stocks. The IC50 values were determined by nonlinear regression analysis, with sigmoidal dose-response 4-parameter logistic equation. Results: The results showed that the best DPPH and H2O2 scavenging was observed with E ritro extracts. On the contrary, the best enzyme inhibition profile was observed with H europaeum against CAT, SOD, GPX and GST targets. Among the enzymes evaluated, all plants with different fractions also exerted strong GPX and CAT inhibition. Conclusion: The enzyme profiling of extracts may reveal the medicinal value of herbal remedies, by identifying their effects on cellular targets. In addition to define how reasonable the use of plants in traditional and complementary medicine (TCM) practices,these efforts may help to improve the standardized supplement preparations to benefit therapeutics with reduced efficiency due to inference with cellular defense and drug resistance enzymes, or both.Article Citation Count: 6Comparison of NAT1, NAT2 & GSTT2-2 activities in normal and neoplastic human breast tissues(Aepress Sro, 2006) Geylan-SU, YS; Isgör, B; Coban, T; Kapucuoglu, N; Aydintug, S; Iscan, M; Güray, T; Chemical EngineeringIn this study, arylamine N-acetyltransferases, NATs (E.C.2.3.1.5) and glutathione-S-transferase-T2-2, GSTT2-2 (E.C.2.5.1.18) enzyme activities in the breast tumor and surrounding tumor-free tissues of 22 female breast cancer patients with infiltrating ductal carcinoma were measured. The possible impacts of grade of malignancy, chemotherapy treatment, estrogen receptor status and menopausal status on all enzyme activities were evaluated. The results showed that, both NAT2 and GSTT2-2 display significant differences between tumor and tumor-free breast tissues, while no difference was observed in NAT1. Grade of malignancy seems to be positively associated with NAT1 and negatively associated with GSTT2-2. Though, both NAT2 and GSTT2-2 have increased mean tumor activities, the grade of malignancy, chemotherapy status, menopausal status or estrogen receptor status are not correlated statistically.Article Citation Count: 1Computer vision based automated cell counting pipeline: A case study for HL60 cancer cell on hemocytometer(Scientific Publishers of India, 2018) Özkan,A.; İşgör,S.B.; Şengül,G.; İşgör,Y.G.; Department of Electrical & Electronics Engineering; Computer Engineering; Chemical EngineeringCounting of cells can give useful information about the cell density to understand the concerning cell culture condition. Usually, cell counting can be achieved manually with the help of the microscope and hemocytometer by the domain experts. The main drawback of the manual counting procedure is that the reliability highly depends on the experience and concentration of the examiners. Therefore, computer vision based automated cell counting is an essential tool to improve the accuracy. Although the commercial automated cell counting systems are available in the literature, their high cost limits their broader usage. In this study, we present a cell counting pipeline for light microscope images based on hemocytometer that can be easily adapted to the various cell types. The proposed method is robust to adverse image and cell culture conditions such as cell shape deformations, lightning conditions and brightness differences. In addition, we collect a novel human promyelocytic leukemia (HL60) cancer cell dataset to test our pipeline. The experimental results are presented in three measures: recall, precision and F-measure. The method reaches up to 98%, 92%, and 95% based on these three measures respectively by combining Support Vector Machine (SVM) and Histogram of Oriented Gradient (HOG). © 2018, Scientific Publishers of India. All rights reserved.Master Thesis Daedalea quercına mantar özütünün antioksidan enzim aktiviteleri üzerine etkisi(2016) Rashuan, Amal Saad Mohamed; İşgör, Sultan Belgin; Chemical EngineeringSon yıllarda mantarlar ve mantar özütleri özellikle bağışıklık sistemini güçlendirerek sağlık üzerine olumlu etkilerinden dolayı gıda takviyesi olarak önemli bir ilgi odağı olmuşlardır. Mantarlar, diyabetten kansere kadar çok farklı hastalığın tedavisinde önemli rol oynarlar. Tıp tarihi boyunca klinikte etkili olan pek çok ilaç mantarların kimyasal bileşiminden geliştirilmiştir. Bu çalışmada, kuru Daedalea quercina (L) Pers. mantarı methanol, etanol ve su kullanılarak farklı özütleme aşamalarından geçirilerek mantara ait toplam fenol ve flavonoid içerikleri ölçülmüştür. Daedalea quercina (L) mantarının biyolojik hedefler için olası tıbbi potansiyelinin belirlenmesi için mantarın methanol özütünün katalaz, glutatyon-S-Trasferaz ve superoksit dismutaz antioksidan enzimleri üzerine etkinliği incelenmiştir. Sonuçlar göstermiştir ki, en yüksek fenolik içeriği 242g GAE/ml ve flavonoid içeriği de 82,562g QE/ml değerleri olarak mantarın methanol özütünde tespit edilmiştir. Mantara ait, 2-2 difenil-1-pikrilhidrazil (DPPH) radikal süpürücü etki inçelenmiş metanolde özütlenmiş mantarın radikal süpürücü etkiyi %50 oranında inhibe ettiği ve bu inhibisyon için IC50 değeri de 0.081 g/L olarak hesaplanmıştır. Daedalea quercina (L) Pers. mantarının CAT ve GST enzimi üzerine etkileri incelenmiş mantarın maximum inhibisyon etkisi GST için 0.05583g/L, CAT enzimi için 0.1458 g/L IC50 değerlerinde gözlenmiştir. Daedalea quercina mantarının methanol özütü SOD enzim aktivitesini %50 den daha az inhibe etmiş olup anlamlı bir IC50 değeri hesaplanamamıştır.Article Citation Count: 1Diplotaxis tenuifolia ve Reseda lutea Metanol Özütünün Antioksidan Savunma Sistemi Enzimleri ve Aldoz Redüktaz Aktivitesi Üzerinde Olan Etkisinin İncelenmesi(Turkish Pharmacists Assoc, 2018) Abdalrahman, Khalid Sharro; Güneş, Merve Gülşah; Shomalı, Naznoosh; İşgör, Belgin Sultan; Yıldırım, Özlem; Chemical EngineeringAmaç: Bu çalışmada Diplotaxis tenuifolia ve Reseda lutea’nın çiçek ve yapraklarından elde edilmiş olan metanol özütlerinin AR, CAT, GST ve GPx enzimlerinin aktiviteleri üzerinde olan etkilerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışmada, bitki örneklerinin toplam fenolik ve flavonoid içeriği; Folin-Ciocalteu ve alüminyum klorür reaktiflerinin yardımıyla kolorimetrik yöntemlerle değerlendirilmiştir. Ayrıca özütlerin CAT, GST, GPx ve AR enzimlerinin aktiviteleri üzerindeki etkileri kinetik analizler ile araştırılmıştır. Bulgular: En yüksek miktarda fenolik ve flavanoid içeriği sırasıyla 144.49±0.29 mg gallik asit eş değeri/L ve 250.485±0.002 quercetin eş değeri/L tespit edilmiştir. GST ve GPx için en iyi aktivite profilleri sırasıyla 121±0.05 ve 140±0.001 ng/mL IC50 değerleri ile D. tenuifolia yaprak özütünde gözlemlenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre, R. lutea ve D. tenuifolia’nın yapraklarından elde edilen metanol özütleri, AR enzimi üzerinde önemli ölçüde bir aktivite potansiyeli göstermemiştir. Bununla beraber, çalışılmış olan çiçek ve yaprak özütlerinin hiçbiri yeterli düzeyde CAT aktivasyonu gösterememiştir. Sonuç: Çalışma sonucunda, D. tenuifolia’nın yapraklarının antioksidan enzimatik savunma sistemi üzerinde iyi bir etkiye sahip olduğu gösterilmiştir. Bu sebeple günlük diyet için iyi bir besin kaynağı olarak kabul edilebilir.Conference Object Citation Count: 1Diversity of glutathione S-transferases in bovine liver(Blackwell Publishing, 2005) Isgor, BS; Coruh, N; Iscan, M; Chemical Engineering[No Abstract Available]Article Citation Count: 8Effect of Alpha-1-Adrenoceptor Blocker on Cytosolic Enzyme Targets for Potential use in Cancer Chemotherapy(Asian Network Scientific information-ansinet, 2012) Isgor, Belgin S.; Isgor, Yasemin G.; Chemical EngineeringDoxazosin is one of the quinazoline-based alpha 1-adrenergic receptor antagonists in clinical use for the treatment of hypertension and benign prostate hyperplasia. Doxazosin-induced cytotoxicity studies, resulted in growth inhibition and apoptosis, show its potential therapeutic benefits for several forms of cancers. These effects on cells occur as adrenoceptor-independent mechanisms, as observed with other quinazoline family of alpha-1 blockers. Moreover, Doxazosin induced apoptosis is associated with pathways, including EGFR, NF-kappa beta and TGF-beta signaling which typically engage Src as a central signaling component. Recent evidences show that glutathione transferases, may also contribute to these signaling events, through the kinases that share signaling pathways with Src, responsible for the regulation of transferase activity. In addition, the overactive glutathione transferases are related with anticancer drug resistance, as well as cancer development. Therefore, in the present study, the anticancer potential of Doxazosin was investigated by in vitro enzyme assays that were used to develop full dose-response profiles of drug at varying doses. The drug dose that exerts 50% inhibition of enzyme activity is defined as IC50 value and determined through the nonlinear regression analysis of dose-response data. The IC50 values determined for Src kinase, total protein tyrosine kinase, cytosolic total Src family kinase and total glutathione transferase enzymes were within nanomolar to low micromolar range. These results suggest that Doxazosin may be used to improve multifunctional therapeutic formulations to provide reduced drug resistance and enhanced cytotoxicity at target tissues.Conference Object Citation Count: 0The effect of doxazosin on selected kinase and glutathione transferases to evaluate its potential for therapeutic use in various cancers(Wiley-blackwell, 2011) Isgor, Y. G.; Isgor, B. S.; Chemical Engineering[No Abstract Available]Article Citation Count: 0The effect of folic acid supplementation and folate deficiency on embryo implantation(Elsevier, 2024) Ozdemir, Elif Seda; Bulut, Deniz Irem; Saglam, Atiye Seda Yar; Isgor, Belgin; Elmas, Cigdem; Chemical EngineeringImplantation is a critical stage of pregnancy, which occurs in a short period of interaction between the receptive endometrium and the embryo. Folic acid (FA) is a synthetic derivative of folate and is recommended as a preconceptional supplement. However, the impact of different doses of FA supplementation and folate deficiency during the early stages of pregnancy requires further investigation. The aim of this study was to investigate the possible effects of FA supplementation and folate deficiency on expression of Estrogen Receptor Alpha (ER-alpha), Vascular Endothelial Growth Factor-A (VEGFA), and Integrin alpha V and beta3 (Integrin alpha V beta 3). A total of 32, 6-8-week old Wistar albino rats were divided into four groups of control, folate-deficiency, low-dose, and highdose FA supplement groups. After five weeks of FA supplementation and folate deficiency model formation, mated rats were sacrificed on the 5th gestational day (GD), and implantation sites were collected. The expression of ER- alpha, VEGFA, and Integrin alpha V beta 3 in the implantation sites were examined with immunohistochemistry and real-time PCR. The results revealed that the mRNA levels of ESR1, VEGFA, and Integrin alpha V and beta 3 were significantly increased in the high-dose FA group and significantly decreased in the folate deficiency group compared to the control group (p < 0.05). Based on these results, it can be concluded that FA supplementation before pregnancy has positive effects on the maintenance of pregnancy, and folate deficiency may lead to implantation disorders.Conference Object Citation Count: 0Effect of novel pp60c-src inhibitors on mammalian glutathione S-transferase activity(Amer Chemical Soc, 2010) Isgor, Belgin Sultan; Isgor, Yasemin Gulgun; Kilic-Kurt, Zuhal; Olgen, Sureyya; Chemical Engineering[No Abstract Available]Master Thesis Enrofloksin ve tylosin'in seçili enzimler üzerine biyokimyasal olarak değerlendirilmesi(2018) Alatrash, Taher Mehemed A; İşgör, Sultan Belgin; İşgör, Yasemin Gülgün; Chemical EngineeringGram pozitif ve gram negative bakterilere karşı gösterdikleri etki nedeni ile Enrofloksin ve Tylosin antibiotikleri veterinerlikte yaygın olarak kullanılmaktadır. Bununla beraber özellikle Katalaz (KAT), Superoksit dismutaz (SOD), Glutatyon-S-Transferaz (GST) ve Glutatyon Peroksidaz (GPX) gibi bazı antioksidan enzimleri inhibe ederek vücutta negative etkilere sebep olabilmektedirler. Bu çalışmada söz konusu antibiyotiklerin adı geçen enzimler üzerine etkisi değerlendirilmiştir. Enroflaxin DMSO da çözünürken Tylosin suda çözünmüştür. Her iki antibiyotik de 1mg/ml stok derişimde hazırlanmıştır. İlaçlara ait stabilite testleri absorbsiyon spekturumu ölçülerek test edilmiş, maksimum absorbsiyon Enroflaksin için 276 nm ve Tylosin için de 282 nm olarak ölçülmüştür. Üç ay süren testler sonucunda her iki ilacın da karanlık ortamda +4 C° ve oda sıcaklığında kararlı olduğu sonucuna varılmıştır. Seri seyreltmelerle hazırlanmış olan farklı derişimlerdeki ilaçlarla yürütülen enzim çalışmalarının sonucunda, Enroflaksin'in KAT ve GST aktivitelerini sırasıyla %10 ve % 15 oranında azaltırken GPX aktivitesini % 15 oranında artırdığı bulunmuştur. Tylosin'in KAT ve GST üzerine etkisi bulunmazken GPX aktivitesini % 10 oranında artırdığı gözlenmiştir. Sonuç olarak Enrofloksin ve Tylosin'in oksidatif stress yaratmadığı gibi, her iki ilacın da kullanılmasının antioksidan enzimler üzerine bir etki yaratmadığı da gözlenmiştir.Article Citation Count: 5THE EVALUATION OF INHIBITORY EFFECTS OF SELECTED PLANT EXTRACTS ON ANTIOXIDANT ENZYMES(Parlar Scientific Publications (p S P), 2015) Moghaddam, Naznoosh Shomali; Isgor, Belgin S.; Isgor, Yasemin G.; Geven, Fatmagul; Yildirim, Ozlem; Chemical EngineeringPlants and most of the plant derived compounds have been known because of their potential pharmaceutical effects for a long time. They are playing an important role on the treatment of several diseases from diabetes to various types of cancers. Today most of the clinically effective pharmaceuticals are developed from plant derived ancestors in the history of medicine. In this study different parts of the plants, namely Centaurea virgata (Lam.), Cichorium intybus (L.), Euporbia macroclada (Boiss.), Melilotus of ficinalis (L.) Pall. and Zygophyllum fabago (L.) were evaluated for their potential medicinal value in terms of biological targets which are participating in antioxidant defense such as catalase (CAT), glutathione-S-transferase (GST), superoxide dismutase (SOD) and glutathione peroxidase (GPx). The results indicate that the highest total phenolic contents of leaf and flower extracts were for E. macroclada. The highest flavonoid contents are detected for the leaves of E. macroclada and Z. fabago. The evaluation of extracts against biological targets reveals that the fruit extract of Z. fabago and the flowers of C. intybus show the inhibition against GST. For CAT, the highest inhibition is observed with E. macroclada leaf extract. Among the extracts analyzed, the only but slight SOD inhibition is determined with flower part of E. macroclada.Article Citation Count: 4Evaluation of Perylenediimide Derivatives for Potential Therapeutic Benefits on Cancer Chemotherapy(Wiley, 2012) Keskin, Taner; Isgor, Belgin S.; Isgor, Yasemin G.; Yukruk, Funda; Chemical EngineeringPerylene derivatives, known to have potential therapeutic benefits on particular cancer types as photosensitizers, may also function as small-molecule inhibitors with promising therapeutic value for diverse diseases. This recently recognized biological activity was attributed to their capacity to modulate the function of various enzymes as biological targets in vitro. Although the inhibitory activity on glutathione transferase and Src tyrosine kinase is important in determining the anticancer potential of compounds for target-specific drug design and development, to date, there are no successful inhibitors of this kind. Moreover, there are only a few studies about the effects of perylene derivatives on glutathione transferase and various kinases. In this study, four novel perylene compounds, N,N'-disubstituted perylenediimides and their 1,7-dibromo derivatives, were synthesized and evaluated for their biological activities. Here, among the compounds analyzed, one of them was identified with strong glutathione transferase inhibition and two with dual activity for both glutathione transferase and c-src inhibition. These results revealed that perylene derivatives may be employed as potential chemosensitizers to prevent chemotherapy-dependent drug resistance and identified as prospective anticancer agents with dual activity on both glutathione transferase and c-src enzymes.
- «
- 1 (current)
- 2
- 3
- »